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AP 生物/基因及其運作

來自華夏公益教科書,開放的書籍,為開放的世界

這篇文章只有一個貢獻者。因此,它可能很糟糕(在看起來不錯方面),完全偏離主題(並且處於事故現場),或者片面(這如何適用於生物學文章?)。所以加入進來,防止潛在的小貓死亡人數增加。

基礎知識

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當然,讓我們從簡單開始。一個基因DNA的一部分,它編碼一種特定的蛋白質。人有數萬個基因!例如,TP53基因編碼p53蛋白。特殊的酶進入細胞核並“讀取”基因。它們從RNA中複製一個複製。RNA與DNA完全相同,但不同之處在於

  • RNA不像DNA那樣被困在細胞核內,
  • RNA是單鏈的,並且
  • RNA使用鹼基尿嘧啶而不是胸腺嘧啶

RNA被傳遞給核糖體,核糖體讀取RNA鏈並使用RNA上的資訊來製造多肽鏈,然後多肽鏈摺疊,然後 - 瞧! - 你就有了自己現成的蛋白質。多肽鏈是連線在一起的氨基酸的長鏈。製造蛋白質需要二十種必需氨基酸。

整個過程稱為表達,基本上意味著特定基因編碼的任何東西都被付諸行動。

更難的內容

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現在我們正在進入細節。在你理解基礎知識之前不要閱讀這部分內容。你可能會感到困惑,然後對我們要說的內容產生錯誤的理解!

整個過程被分成兩個步驟:轉錄翻譯轉錄是首先進行的過程,即DNA被複製成RNA鏈。另一方面,翻譯是對該RNA鏈上的資訊的讀取,並根據該RNA鏈製造蛋白質。

關於RNA

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在我們深入資訊海洋之前,我們需要了解更多關於RNA的資訊。

實際上,RNA有三種類型

  • 信使RNA,也稱為mRNA,是DNA的複製品,核糖體讀取它。
  • 核糖體RNA,或rRNA,構成核糖體。這種RNA本身沒有任何遺傳資訊。
  • 轉運RNA,或tRNA,在翻譯過程中將氨基酸帶到核糖體。(別擔心太多 - 現在 - 我們將在翻譯部分更深入地討論它。)

當基因準備表達時,轉錄起始因子RNA聚合酶一起進入並結合到DNA的被稱為啟動子的地方。(RNA聚合酶是這裡的關鍵 - 它實際上將DNA複製成mRNA鏈。轉錄起始因子只是為了幫助RNA聚合酶結合到DNA。)然後,RNA聚合酶解開並分開DNA片段以形成轉錄泡(否則RNA聚合酶無法讀取核苷酸序列,因為DNA兩側的核苷酸透過氫鍵結合在一起)。轉錄起始因子離開。然後,根據互補性規則,RNA聚合酶從模板鏈開始轉錄DNA。以下是它的工作原理(編碼序列完全是虛構的)

轉錄延伸的簡單示意圖

這是RNA聚合酶想要轉錄的DNA片段

T A C G A A

RNA聚合酶讀取第一個核苷酸,並且根據互補性規則,胸腺嘧啶腺嘌呤配對(^表示RNA聚合酶的當前位置)

T A C G A A
A          
^          

由於RNA使用尿嘧啶而不是胸腺嘧啶,RNA聚合酶將為位置2分配一個尿嘧啶核苷酸

T A C G A A
A U        
  ^        

胞嘧啶鳥嘌呤配對

T A C G A A
A U G      
    ^      
T A C G A A
A U G C    
      ^    

我們已經知道最後兩個

T A C G A A
A U G C U  
        ^  
T A C G A A
A U G C U U
          ^

RNA聚合酶完成製作mRNA鏈後,mRNA鏈與RNA聚合酶一起釋放,DNA重新形成雙螺旋。

然而,我們的小夥伴mRNA在這裡還沒有完成。mRNA鏈,即初級mRNA鏈,被賦予一個5'帽子(一個修飾的鳥嘌呤核苷酸)和一個poly-A尾(只是一系列腺嘌呤核苷酸)。然後,剪接體進入並切斷mRNA的某些部分。這並非隨機的;剪接體切除的是RNA的內含子片段,只留下外顯子。外顯子是編碼蛋白質的遺傳資訊部分(表達的部分)。內含子不編碼蛋白質。那麼它們為什麼存在?它們曾經被稱為垃圾,但現在科學家認為內含子可能有一些功能。我們曾經認為人類大約有10萬個基因,但現在看來我們可能只有大約3萬個!我們只有3萬個基因怎麼可能存活下來?好吧,存在不同的假說。一種假說是這些內含子可能具有酶的功能。另一種是內含子允許外顯子重新排列,因此你可以製造數百種蛋白質而不是隻製造一種蛋白質。或者內含子是某種分子訊號,它告訴細胞該做什麼。

好吧,回到地球。一旦添加了帽子和poly-A尾,並且內含子被剪接,我們就得到了成熟的mRNA。重要的是要注意,原核生物沒有剪接體,因此沒有內含子。

在我們深入翻譯之前,你需要更多地瞭解tRNA

正如你在基礎知識中所瞭解的,tRNA將氨基酸帶到核糖體。但是怎樣呢?

在這種情況下,氨基酸是亮氨酸。

以下是過程。tRNA是RNA片段,它們有兩個重要的東西:氨基酸本身和反密碼子。三核苷酸反密碼子的序列(核糖體以三個為單位讀取 - 三個核苷酸一起構成一個密碼子)決定了哪個氨基酸被連線。例如,如果一個tRNA分子具有反密碼子CCA、CCG、CCU或CCC,則該tRNA分子將具有甘氨酸氨基酸。

核糖體

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核糖體由rRNA構成。它們實際上製造了摺疊成蛋白質的多肽鏈。但是怎樣呢?

現成的核糖體需要一些組裝,因為它們以兩個半部分或核糖體亞基的形式出現。不過,你不能真的稱它們為半部分,因為其中一個“半部分”比另一個大。

第一步是當大核糖體亞基和小核糖體亞基連線到一條mRNA鏈上。現在轉運RNA就發揮作用了。一個轉運RNA進入(第一個密碼子,即三個核苷酸在一起,始終指示蛋氨酸[AUG])並透過它的反密碼子連線到第一個密碼子上。現在第二個tRNA進入並結合到第二個密碼子上。然後核糖體*啪!*從第一個tRNA上取下氨基酸,並將它與第二個tRNA的氨基酸結合在一起。然後第一個tRNA跑掉去獲取另一個氨基酸,而核糖體沿著mRNA移動,允許另一個tRNA結合到第三個密碼子上。這個過程重複進行,直到核糖體到達mRNA上的終止密碼子,此時一個釋放因子與終止密碼子結合(因為終止密碼子沒有相應的反密碼子),並啟動兩個核糖體亞基的分解。由此產生的多肽鏈也被釋放出來摺疊,成為一個完全功能的蛋白質。

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