生物資訊學/生物多樣性
外觀
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本部分側重於廣闊的概念,而對有用的技術細節則相對較少。我應該把這部分移到最後(在我決定如何處理當前第四部分的主題之後),儘管這會破壞敘述。
我對整個種群的計算機模型瞭解不多(相對而言),但這無疑屬於計算生物學,絕對應該包含在這裡。
第一章將解釋序列的差異,這些差異使生物體能夠在不同的環境或不同的化學底物上繁衍生息。
第二章將討論觀察到的生物體複雜性與其基因組複雜性之間的關係。
第三章討論了全基因組分析如何得出結論,即所有已知生命形式都起源於一個共同的祖先。這裡將對我們如何得出這一結論,以及我們對這種祖先生物的瞭解進行一些討論。如果篇幅允許,我可能會新增一章關於地球上生命的起源。
第四章不言自明。
第五章將討論全基因組分析如何讓我們得出結論,葉綠體和線粒體源於真細菌內共生體。
第六章主要致力於與發育相關的基因的計算研究,特別是與在酵母等單細胞生物中發現的同源基因的比較。
第七章討論了測量有效種群大小的方法,以及有效種群大小在生物體基因組的真實多樣性方面意味著什麼。如果種群遺傳學教科書最終完成,我希望將大部分內容從那裡遷移過來。
第八章將第七章的討論擴充套件到一個特殊的案例,即種群在有限的基因接觸下分裂成多個群體。