生物實驗室技術/細胞分離
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細胞分離是一種標準程式,用於根據細胞在離心機中不同的分離方式來分離亞細胞器。細胞器在離心機中根據密度、形狀和大小分離。細胞核通常是第一個在離心機中沉澱的細胞器。
細胞分離中最重要的裝置是離心機。離心機是一種高速旋轉的裝置,對旋轉的物體施加向心力。離心機中的所有粒子都會感受到相同的力,但密度較大的粒子會在液體中移動得更快,並以比密度較低的粒子更小的力沉澱下來。
離心加速度(或向心加速度)通常用重力加速度的倍數表示。例如,如果離心機施加的力與重力施加的力相同,則表示為 1 G。如果它施加的力是重力的 10 倍,則表示為 10 G。相對離心加速度(通常稱為相對離心力)可以使用公式 RCF= (r X RPM2 X (2π)2 * (100/36))/(10002 X g) 計算,其中
- r = 樣品距離心機中心的半徑,以釐米為單位
- RPM = 每分鐘轉數
- g = 重力常數 (9.8 m/s2)
此公式通常簡化為 RCF = 11.19 X r X (RPM/1000)2
如果您的離心機無法獲得指定的 RCF,則可以透過更長時間離心來彌補。例如,如果一個程式要求以 10,000G 的 RCF 離心 60 秒,但您的離心機只能獲得 9,000 G,則可以透過離心 67 秒來彌補。確定所需補償時間的公式為:tr = (ts X RCFs)/RCFmax,其中
- tr = 您離心機所需的時間
- ts = 說明書中規定的時間
- RCFs = 說明書中規定的 RCF
- RCFmax = 您的離心機可以獲得的最大 RCF
差速沉降
- 細胞器的分離是可能的,因為粒子往往以不同的速率沉降。有幾個因素決定沉降速率。
- 密度:在所有其他條件相同的情況下,粒子密度越大,沉降速度越快。然而,如果粒子的密度與樣品中液體的密度相同,則它根本不會沉降。但是,如果粒子比液體介質密度低(例如,油脂和脂類放置在水中時),它會移動到介質的頂部。
- 尺寸:在所有其他條件相同的情況下,粒子越大,沉降速度越快。如果兩塊尺寸不同但密度相同的岩石從船上掉下來,較大的岩石往往會更快沉沒。這是因為有更多的質量(假設密度相同)可以受到重力的作用。較大的質量更容易克服水的摩擦並更快下沉。這並不意味著重力對不同的質量作用不同。這只是另一種描述它所經過的介質作用的方式。一根羽毛會比一袋羽毛掉得慢。然而,在真空中,它們會以相同的速度下落。
- 粘度:液體介質的粘度(或厚度)會減緩沉降速度。如果兩個粒子的尺寸和密度比較接近,並且只有很小的差異,則可以透過增加液體介質的粘度來將它們分離。
此過程允許分離細胞核、線粒體和細胞膜。
- 試劑
- 分離緩衝液
- 250 mM 蔗糖(約 4.28g 在 50 mL 中)
- 20 mM HEPES(pH 7.4)
- 10 mM KCl(0.0373 g 在 50 mL 中)
- 1.5 mM MgCl2
- 1 mM EDTA
- 1mM DTT
- 蛋白酶抑制劑(1X 濃度)
- 注意:僅在使用時新增 DTT 和蛋白酶抑制劑!
- 實驗室裝置
- (1) 10 釐米培養皿
- (3) 1.5 毫升 Eppendorf 管(管子的確切數量取決於所需的餾分)
- (1) 25 Ga 針頭
- (1) 1 毫升注射器
- (1) 冰塊容器(孵育)
- (1) 一套微量移液器
- (1) 超聲波清洗器
- (1) 離心機,能夠
--- 720 G (for nuclear fraction) --- 10,000 G (for mitochondrial fraction) --- 100,000 G (for cell membrane fraction)
- ↑ https://tfhub.dev/google/experts/bert/wiki_books/2