該階段涉及使用之前產生的 NADH 分子以及來自還原電子載體的電子，以形成 ATP 分子。在真核生物中，此過程發生在有絲分裂中，而在耐氧原核生物中，則發生在細胞膜中。某些真核細胞（例如紅細胞）沒有有絲分裂，因此無法使用電子傳遞鏈產生能量。
在植物細胞中，能量源於太陽，用於開啟產生 ATP 的化學反應。
