化學資訊來源/SIRCh/化學資訊學/資料標準和標準組織

SIRCh：化學精選網際網路資源

分子資料標準

• InChI IUPAC國際化學識別符號
• inchi.info
• SMILES
• 結構資料格式 (SDF) 檔案
• CT檔案 (MDL)
• CML (化學標記語言) 在SourceForge
• 化學標記語言 (CML) (原始網站)
• 化學標記語言 (CML) (原始釋出者)
• 化學MIME主頁
• CambridgeSoft CDX 用於ChemDraw [參見軟體開發工具包]
• CXF : 化學交換格式，1.0版 / (化學文摘社書籍可從印第安納大學化學圖書館獲得: QD8.3 .C97 1994)
• 晶體學資訊檔案格式 (CIF)
• 大分子晶體學資訊檔案 (mmCIF)
• 編碼歸檔描述 (EAD)
• EPrints
• Glossolalia：一種通用的MS資料語言 (mzXML：系統生物學研究所)

• MDL的CT檔案格式 (參見“下載產品”)
• 微陣列實驗的最小資訊 (MIAME) (MGED協會)
• MIRIAM - 生物學計算模型的標準 (Biomodels.net)
• NCBI C++工具包
• netCDF (網路通用資料格式)

• 元資料收割的開放檔案倡議協議
• PDB - 蛋白質資料庫
  • PDB詞典資源
  • PDB檔案格式
• SBML - 系統生物學標記語言
• SMRS：標準代謝報告結構
• Tripos Mol2檔案格式
• UniProtKB/Swiss-Prot 文件
• VOTable格式定義

分子標準組織

• 藍色方尖碑
• caBIG相容性和認證

• CiDX：化學工業資料交換
• ERCC - 外部RNA控制聯盟 (美國國家標準與技術研究院)
• NARSTO和美國環保署超級網站計劃指南檔案
• HUPO蛋白質組學標準倡議 (人類蛋白質組組織)
• PSI-MS: 質譜標準工作組 (mzData標準)
• IUPAC CPEP電子資料標準分委會 (JCAMP-DX的繼任者)
• littleb.org
• LSIT全球研究所
• 微陣列和基因表達 (MAGE) (MGED協會)
• MAQC - 微陣列質量控制專案 (美國食品藥品監督管理局)

• NISO (國家資訊標準組織)
• OAIster
• OMG生命科學研究組
• 開放檔案倡議

化學結構格式轉換器

• Open Babel
• Mol2Mol
• CLiDE (SimBioSys的化學文獻資料提取工具)
• ACD/ChemSketch
• Corina (分子網路)