化學資訊來源/出版流程
主要、次級和三級資源
傳統上，科學研究工作首先發表在期刊文章中（稱為主要文獻）。然後，它會被各種次級工具收集起來，這些工具的目的是更好地組織主要文獻，並使檢索感興趣的專案變得更加容易。其中最重要的是文摘和索引（A&I）服務，例如化學文摘社、科學引文索引、Reaxys 和 Scopus。在化學覆蓋範圍的深度和廣度以及新主要作品的平均參考文獻進入 A&I 資料庫的速度方面，次級 A&I 服務之間存在差異。科學出版現在正在發生一項非常重大的變化。諸如美國化學學會的“儘快發表”的新期刊文章流程等創新，使得原始研究文章的網路版本比相應的印刷版本提前幾周出現。向電子期刊作為科學檔案記錄的轉變已接近完成。許多化學圖書館已決定停止訂閱印刷期刊。由於有如此多的新資訊可用，還有其他來源有助於篩選、壓縮和重新打包最重要的發現。例如，有些人撰寫了關於一段時間內特定科學領域發生的事情的綜述。當然，一旦新的發現得到驗證並被認為足夠重要，它們就會出現在各種書籍、百科全書和其他次級資源中。
主要文獻是指研究人員首次在公開可訪問的文件中向科學界揭示科學研究結果的地方。在許多情況下，描述這些結果的文件已經過一位或多位同行嚴格審查，這些同行有助於確保科學知識的完整性。然而，我們越來越多地看到 預印本 出現在網路上，這些預印本是未經審查的文獻，由原作者釋出。更傳統的初級出版物包括科學期刊文章、已出版的會議論文集、技術報告、學位論文或畢業論文和專利。所有這些統稱為 文件。
不同型別的文獻在主要文獻的每個 文件型別（期刊文章、專利、論文等）中都包含不同的資訊和不同級別的細節。由於情況如此，有時在進行搜尋時區分文件型別很重要。因此，為了幫助檢索，主要文件的型別可能會在資料庫或印刷文摘或索引期刊中編碼，這些期刊涵蓋了多種型別的文件。
讓我們看看一些人們可能期望在任何一家信譽良好的化學圖書館中找到的期刊名稱。美國化學學會專業培訓委員會發布了推薦期刊列表，供本科課程使用。該列表包括商業新聞期刊，如《科學》和《自然》，主要研究期刊，如《無機化學》，以及旨在快速傳播新研究成果的主要期刊，如《化學通訊》和《四面體快報》。該列表中還有一些次級來源，如《化學評論》。
另一方面，科學出版中的一個新趨勢是 開放獲取，由布達佩斯開放獲取倡議定義為在開放網際網路上免費提供文獻，允許使用者閱讀、下載、複製、分發和列印全文。開放獲取（OA）期刊的資金來源多種多樣，包括文章處理費（APC）、資助和學會或機構的直接支援，以代替訂閱收入。APC 由個人、機構或資助資金支付給已接受手稿的作者。然而，許多 OA 期刊沒有 APC 或免除資金有限的作者的費用，使文章對讀者和作者都是免費的。此外，許多 OA 期刊要求手稿經過與傳統訂閱期刊相同的嚴格同行評審流程。開放獲取文章的潛在受眾遠大於訂閱期刊文章。與需要訂閱才能閱讀的文章相比，OA 文章通常具有更多下載量，並且很有可能具有更多引用量。然而，與某些領域不同，化學領域的大多數著名期刊仍然是訂閱式的，這使得它們對作者更有吸引力。
開放獲取期刊目錄包含數千種 OA 期刊名稱，其中一些期刊是化學期刊。許多訂閱期刊的出版商現在允許作者支付文章處理費，這使得他們的文章可以在發表後立即公開獲取。包含 OA 和需要訂閱的文章混合的期刊被稱為混合開放獲取期刊。兩個此類專案的例子是英國皇家化學會的開放科學和美國化學學會的作者選擇選項。
SPARC（學術出版與學術資源聯盟）是由 ARL（研究圖書館協會）開發的，旨在倡導學術交流方面的變化。SPARC 發起了一個開放獲取工作組，該工作組正在為開放獲取研究的集體倡導構建框架。
其他型別的主要文獻包括大多數技術報告、學位論文和畢業論文、專利和市場研究報告，這些將在本書的其他章節中進行討論。
撰寫和出版化學期刊文章
在化學家撰寫論文之前，他/她必須確定目標讀者群體以及哪些期刊可以接觸到他們。如果作者選擇了錯誤的期刊，它可能會被退回，並附帶評論“這項工作不適合本期刊”。作者應該對該主題進行文獻檢索，以確定哪些期刊發表了該領域的論文。在選擇期刊時，應考慮其聲望、訪問許可權、出版速度、目標讀者群體和影響力。確定這些因素的一種方法是查詢由湯森路透出版的稱為期刊引文報告的訂閱資料庫。它提供了一種系統且客觀的工具來批判性地評估世界領先的期刊，並提供可量化的統計資訊。一個重要的標準是期刊影響因子，它衡量的是期刊中“平均文章”在特定年份或期間被引用的頻率。因此，作者可能希望查詢期刊引文報告，以找到他們專業領域中影響因子高的期刊，但正如上文所述，這不應是唯一的決定因素。現在有許多免費網站評估期刊的影響力，包括Eigenfactor、SCImago 和Google 學術搜尋期刊指標。
一旦選擇好期刊，化學家就必須查詢期刊網站上的“作者指南”頁面。作者應一次只向一個期刊提交稿件。如果稿件被拒絕，他/她可以向另一家期刊提出投稿。
兩個推薦來源：Robinson, M. S. (2008). Write like a chemist: A guide and resource. Oxford: Oxford University Press.
Day, R. A., & Gastel, B. (2011). How to write and publish a scientific paper. Santa Barbara, Calif: Greenwood.
術語“主要”、“次級”和“三級”文獻在不同作者的解釋中有所不同。我們將稱 次級文獻 為教科書、專著、專著和“編輯文字”（由不同作者撰寫章節的書籍）、百科全書和詞典、手冊和資料彙編、綜述文章和綜述系列、參考文獻以及索引和文摘服務。
所有這些次級作品都具有重新打包和更好地組織研究人員在主要文獻中報告的新資訊的共同目標。由於建立次級作品需要額外的努力（也就是說，它們從主要作品中收集資訊和事實），因此它們始終不如最近釋出的主要文獻那麼及時。
根據編譯工作量的大小，次級作品需要不同時間來重新打包或解釋新知識。因此，從研究想法的產生到各種型別的次級資源，存在一個明確的科學資訊流。人們通常期望在以下情況下找到重新打包的新知識或指向/總結新主要作品的指標：
- 索引工具：新主要作品出現後的幾天到幾周。
- 文摘工具：新主要作品出現後的 1 到 9 個月或更長時間。
- 綜述文章：新主要作品出現後的 1 到 3 年或更長時間。
- 各種彙集作品：以手冊、字典、百科全書等形式重新包裝，最重要的資訊和資料在新的初級作品出版後兩到五年或更長時間出現。
重要的是要理解，滯後時間只與二次出版物或資料庫更新頻率部分相關。以幾十年前的幾個例子為例，兩篇發表在化學會刊資料庫中的期刊文章的滯後時間，該資料庫當時每週更新一次，可以從以下摘要中看出
- CA 摘要 93:25540j 出現在《化學文摘》第 93 卷第 3 期（1980 年 7 月 21 日）上，但原始期刊文章刊登在《美國化學會志》第 102 卷第 7 期（1980 年 3 月 26 日）上。**滯後時間**：明顯為 117 天。
- CA 摘要 106:205033s 出現在《化學文摘》第 106 卷第 24 期（1987 年 6 月 15 日）上，但在《光化學雜誌》第 37 卷第 1 期（1987 年 4 月）上。**滯後時間**：可能為 60-75 天。
因此，摘錄或索引期刊每週甚至每天更新的事實並不一定意味著該 A&I 更新中涵蓋的初級文獻是該周出現的新的初級文獻。恰恰相反，新的初級文獻出現及其在二次文獻中的報道之間幾乎總存在一些滯後時間。但是，對於一些摘錄或索引來源，特別是ingenta（以前稱為 UnCover），滯後時間非常小，大約幾天。
一項正在縮短新初級文獻出版與其在 A&I 服務中收錄之間的滯後時間的進展是，在印刷版本出現之前很久，新期刊文章就開始進行電子出版。“儘快出版”（ASAP）是美國化學會的政策，其他主要出版商（例如 Springer）也制定了類似的早期出版政策，這些政策往往會大大縮短滯後時間。在 ASAP 下，發表在 ACS 期刊上的文章將在主要期刊的電子版中提前兩到六週，比相應的印刷版本提前兩到六週出現。這些文章的參考文獻也比其他出版商的主要期刊早得多地被輸入到化學文摘資料庫（這是 ACS 的一部分）中。
其他類別的二次作品包括目錄、買方指南、傳記作品等。這些在時間意義上不能輕易與初級文獻相關聯。
有一些資料庫與不同的初級和二次印刷來源相對應。它們可以分類為
- **書目**-提供文件的書目，可能包含摘要（摘要），並且越來越多的包含指向初級文件的完整文字的連結。每個記錄都包含識別文件所需的元素，包括期刊名稱、作者、文章標題、卷號、期號、頁碼和出版年份。
- **非書目**-數字、文字、字典和目錄資料庫。
非書目資料庫有時被稱為**事實**或**來源**資料庫，與傳統的書目資料庫相反，後者僅提供指向包含事實的初級出版物的指標。
網際網路，尤其是基於全球資訊網的應用程式，正在加速建立真正的全文資料庫，並模糊了摘錄/索引資料庫和主要期刊之間的界限。網路上的科學全文資料庫包括圖形，例如美國化學會期刊的網路版本。在一些資料庫中，可以找到文章的 HTML 版本和 pdf 版本。HTML 版本可能具有增強功能，例如文章參考文獻中的連結指向 A&I 資料庫中引用的文章的**摘要**（摘要），以及指向引用的舊文章的全文網路版本的進一步連結。例如，現在可以從搜尋化學文摘資料庫的各種選項直接連結到 1000 多種主要期刊，透過ChemPort選項。一個專案 (CrossRef) 提供了從文章中的引用直接連結到引用的文章，而無需將 A&I 服務作為中間步驟。CrossRef 也是學術和專業出版物的官方**DOI**（數字物件識別符號）註冊機構。因此，如果我們找到一個 DOI 識別符號，例如 10.1021/ci050354f，您可以在瀏覽器中輸入 DOI，前面加上 http://dx.doi.org/，例如：http://dx.doi.org/10.1021/ci050354f。
2007 年，英國皇家化學學會在電子期刊文章出版方面邁出了革命性的一步，他們推出了RSC Prospect專案。它提供了從文章中的單詞到其定義的超連結，例如IUPAC 化學術語彙編（金書）和各種生物科學**本體論**（顯示一個學科領域中所有概念和術語關係的方案）。此外，化合物還與結構圖和關於它們的其他資料相關聯。美國化學會開發了一個類似的增強型全文文章計劃，ActiveView PDF。
請注意，一些出版商已將電子版（而不是印刷版）作為文章的正式記錄。此外，一些出版商，尤其是僅線上出版期刊的出版商，已從印刷界放棄了諸如卷號和期號或甚至頁碼之類的識別慣例，而代之以文章編號。
大多數主要化學期刊現在都可以在網路上獲得。請參閱透過印第安納大學化學圖書館訪問的化學電子期刊列表。
資料庫搜尋選項包括
- **線上搜尋**遠端資料庫，超出執行搜尋的組織邊界。
**供應商**線上搜尋服務（例如 STN International）從資料庫**生產商**（例如化學文摘服務或湯森路透）租賃或獲取資料庫，並在遠端計算機上提供這些資料庫。對於給定的供應商，它可能在其計算機上擁有數十或數百個資料庫，這些資料庫都透過通用的**命令語言**或圖形使用者介面 (GUI) 進行搜尋。在某些情況下，尤其是在工業領域，根據連線時間、查詢數量以及顯示、列印或下載的記錄收取按次付費費用。但是，特別是在學術界和大型公司，圖書館或其他實體已協商制定了年度全站固定價格許可證，允許該組織中的每個人無限制地訪問該資料庫。由於訪問通常基於對搜尋者透明的 IP 地址身份驗證（不需要身份驗證），因此一些使用者可能認為他們正在搜尋的資料庫是免費的。另一種選擇是搜尋網路上的免費化學資料庫。一些免費網路資料庫的質量和搜尋功能範圍可能比商業資料庫更有限。儘管如此，即使一個人可以訪問許多訂閱資料庫，也不應忽視免費的網路資料庫。優秀的免費化學網路資料庫的例子包括ChemSpider，它得到英國皇家化學學會的支援，以及美國國家標準與技術研究院的NIST 化學網路手冊。
- **內部搜尋**組織內的資料庫。
大型組織可能會將其自己的計算機上載入資料庫。隨著客戶機/伺服器計算機系統和**網路服務**的出現，現在正在探索幾種提供資料庫搜尋的新模型。
我們將考慮旨在教你如何使用初級和二級作品的作品為**三級**作品。其中很多都是**指南**，實際上，本華夏公益教科書就是一個指南的例子。指南將在另一章中更全面地介紹。
化學文獻的發表形式和資料庫多種多樣。從原始文獻（首次發表原始研究成果的地方）到二次文獻（對原始文獻中首次報道的重要發現進行重新包裝），研究者擁有眾多選擇。化學資訊源的目標是讓您熟悉這些工具，以便您能夠明智地選擇如何有效地滿足您的化學資訊需求。雖然您可能不認為自己精通所有工具，但至少您會意識到這些工具的存在，一旦您完成了本指南的所有章節，您便能夠找到最佳工具來回答您的問題。