MINC/軟體開發/EZMINC/MincifiedTools
非線性微分同胚配準工具，主頁: http://picsl.upenn.edu/ANTS/ 基於版本1.9的MINCIFIED版本可以讀取.mnc檔案，如果輸出副檔名是.xfm，它將為正向和反向變換生成MINC樣式的xfm檔案。注意非線性部分儲存在一個單獨的檔案中，字尾為_grid_0.mnc（從xfm檔案引用）
用於手動分割解剖影像的視覺工具，主頁: http://www.itksnap.org 基於版本2.0.0的MINCIFIED版本
- 原始碼: http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-minc-src2.tar.gz
- 32位Debian軟體包（自包含，不需要minc/netcdf/hdf）： http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Linux-i686-fixed-minc.deb
- 64位Debian軟體包（自包含，不需要minc/netcdf/hdf）： http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Linux-x86_64-fixed-minc.deb
- 32位Mac OS X軟體包（自包含，不需要minc/netcdf/hdf）： http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Darwin-i386-fixed-minc.dmg
警告：如果您使用原始碼，請升級到最新版本的二進位制軟體包或編譯EZminc版本r73或更高版本。之前版本中存在一個錯誤，導致由於層間規範化而偶爾會損壞帶有標籤的minc檔案。
基於版本2.2.0的MINCIFIED版本
- 原始碼: http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.2.0-with-minc.tar.bz2
- 64位Ubuntu 11.04軟體包（自包含，不需要minc/netcdf/hdf）： http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.2.0-20110504-Linux-x86_64.deb
注意：由於神經學和放射學符號之間的差異，mincified版本將無法正確顯示nii檔案（左右交換）。
非線性配準工具，主頁: http://elastix.isi.uu.nl/
- 示例Mincified原始碼: http://www.cim.mcgill.ca/~dante/code/elastix-4.3_minc.tar.gz
注意：ElastiX v4.3必須使用ITK 3.14編譯。此外，ITK 3.14本身必須使用CMake變數ITK USE REVIEW設定為ON，ITK USE REVIEW STATISTICS也設定為ON。請參閱 手冊，以獲取詳細的構建說明。