MINC/軟體開發/EZMINC/Mincified 工具
非線性微分同胚配準工具，主頁：http://picsl.upenn.edu/ANTS/ 基於版本 1.9 的 MINCIFIED 版本可以讀取 .mnc 檔案，如果輸出副檔名為 .xfm，它將生成 MINC 樣式的 xfm 檔案以進行正向和反向轉換。請注意，非線性部分儲存在具有後綴 _grid_0.mnc 的單獨檔案中（從 xfm 檔案中引用）
用於解剖影像手動分割的視覺化工具，主頁：http://www.itksnap.org 基於版本 2.0.0 的 MINCIFIED 版本
- 原始碼：http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-minc-src2.tar.gz
- 32 位 Debian 包（自包含，不需要 minc/netcdf/hdf）：http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Linux-i686-fixed-minc.deb
- 64 位 Debian 包（自包含，不需要 minc/netcdf/hdf）：http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Linux-x86_64-fixed-minc.deb
- 32 位 Mac OS X 包（自包含，不需要 minc/netcdf/hdf）：http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.0.0-20091117-Darwin-i386-fixed-minc.dmg
警告：如果使用原始碼，請升級到最新版本的二進位制包或編譯 EZminc 版本 r73 或更高版本。在先前版本中修復了一個錯誤，該錯誤導致標籤為 minc 檔案偶爾因切片間歸一化而損壞。
基於版本 2.2.0 的 MINCIFIED 版本
- 原始碼：http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.2.0-with-minc.tar.bz2
- 64 位 Ubuntu 11.04 包（自包含，不需要 minc/netcdf/hdf）：http://www.bic.mni.mcgill.ca/~vfonov/software/itksnap-2.2.0-20110504-Linux-x86_64.deb
注意：由於神經學和放射學符號之間的差異，mincified 版本將無法正確顯示 nii 檔案（左右交換）。
非線性配準工具，主頁：http://elastix.isi.uu.nl/
- 示例 Mincified 原始碼：http://www.cim.mcgill.ca/~dante/code/elastix-4.3_minc.tar.gz
注意：ElastiX v4.3 必須使用 ITK 3.14 編譯。此外，ITK 3.14 本身必須使用 CMake 變數 ITK USE REVIEW 設定為 ON 以及 ITK USE REVIEW STATISTICS 也設定為 ON 來編譯。請參閱手冊以獲取詳細的構建說明。