MINC/簡介
BIC[1] 的現任和前任成員編寫併發布了大量影像分析軟體包，其中一些版本可以追溯到 1980 年代後期。其中最知名的是 MINC 檔案格式、工具箱和相關工具。
MINC 檔案格式和工具箱最初由 Peter Neelin 於 1992 年構思、編寫和釋出，原因是當時處理來自不同掃描器和研究小組的多種檔案格式令人沮喪。在隨後的幾年中，許多相關工具（影像配準、標準化、視覺化等）被編寫併發布。
最初的 MINC 檔案格式和工具基於 NetCDF 資料格式，但在大資料集（數 GB）中遇到了問題，因此在 2002-3 年對庫進行了大規模重寫，將資料格式更改為 HDF 以支援大型檔案和其他新功能。這個版本系列稱為 MINC2。對 MINC1 的開發工作在 2006 年的 1.5.1 版本停止。當前所有 MINC2 工具都向後相容 MINC1 格式，但 RMINC 庫和 pyminc（基於 MINC2 API）除外，它們無法直接讀取 MINC1 格式檔案。
當前的 MINC2 庫和工具由世界各地各個影像研究實驗室的開發人員組維護。
這些包括各種影像處理應用程式。以下是這些程式中最重要的一些程式及其應用的簡要列表。
幾何畸變校正
用於估計和校正成像梯度非線性造成的幾何畸變的工具。
N3
N3 包是 MINC 工具的一部分，它實現了一種非引數方法，用於校正 MRI 資料中的強度不均勻性。它的使用往往是任何處理序列中必不可少的第一個步驟。
配準工具/ANIMAL
這套演算法可以將兩幅影像線性或非線性配準到彼此。最常用的 **mritotal** 將 MRI 配準到標準 Talairach 空間。它們都是 MNI AutoReg 包的一部分。ANIMAL 也是 MNI Autoreg 的一部分，它旨在標記 MRI 的主要解剖區域（不同的葉、胼胝體等）。
INSECT
INSECT 是將結構 MRI 分割為三種組織型別的演算法：白質、灰質和腦脊液。它作為分類包的一部分提供。
SEAL
SEAL 代表“Sulcal Extraction and Labelling”，它的用途也基本如其名稱所示。
它也被稱為 PMP，旨在對大量影像資料庫執行一系列處理步驟。
glim_image
glim_image 旨在執行 VBM（體素基質形態測量），換句話說，它對於檢查分割後的組織物質（白質、灰質、腦脊液）的變化與其相關線性模型之間的關係非常有用。
EMMA
EMMA（可擴充套件的 MATLAB 醫學影像分析）是一個工具包，旨在簡化 MATLAB 在醫學影像資料分析中的使用。它提供了用於讀取和寫入 MINC 檔案、檢視影像、執行 ROI 操作和執行幾種流行分析的功能。此外，還有用於執行動態 PET rCBF（區域腦血流）和 FDG 資料的動力學分析的工具包。
RMINC
用於在 R 中讀取和寫入 MINC 體積的 MINC2 庫。它還執行線性模型分析。
fMRI 統計分析
最後，fMRI 統計分析也使用 matlab 進行。
MincView
顯示
配準
MNI ray_trace
JIV2
MINC 包本身和大多數相關工具都使用修改後的 BSD 許可證進行許可。MINC 許可證如下所示，但請注意，某些包使用不同的許可證釋出，例如 GPL。有關詳細資訊，請檢視所選包中的 COPYING 檔案。
版權所有 1993-2000 年，
麥吉爾大學麥康奈爾腦成像中心
蒙特利爾神經病學研究所
麥吉爾大學。
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