指令碼

這些指令碼都可以從packages下載。

volrot

volrot 將繞體積中心旋轉 MINC 體積。此指令碼通常用於解決 MINC 體積的定向問題。例如，要繞 x 軸旋轉 90 度，可以使用以下命令：

  volrot -x_rotation 90 input.mnc output.mnc

nlpfit

nlpfit 執行一個體積到另一個體積的分層非線性擬合。這是透過使用逐漸精細的非線性網格函式將一個影像擬合到另一個影像來完成的。mni_autoreg 包中的 minctracc 用於執行擬合。預設擬合配置檔案包括 16mm、8mm 和 4mm 擬合。作為擬合的一部分，體積也會使用逐漸縮小的 FWHM 核進行模糊，這是為了降低特定級別擬合陷入區域性極小值的可能性。

可以透過建立擬合配置檔案並使用 -config_file 選項更改預設擬合配置檔案。以下是一個示例（預設擬合配置檔案）：

@conf = (
    {'step'         => 16,
     'blur_fwhm'    => 8,
     'iterations'   => 3,
     },
   
    {'step'         => 8,
     'blur_fwhm'    => 4,
     'iterations'   => 2,
     },
   
    {'step'         => 4,
     'blur_fwhm'    => 4,
     'iterations'   => 2,
     },
   );