MINC/教程/Python 示例

Hello World 的 pyminc 版本。

秉承其他關於如何使用 MINC 工具包進行程式設計的教程，這裡是一個簡單的例子，演示如何開啟一個體積，為每個體素加一，然後再次寫入。這是 Python，程式碼非常簡潔！

#!/usr/bin/env python
from pyminc.volumes.factory import *
from numpy import *
import sys

if __name__ == "__main__":

    # get the input file
    infile = volumeFromFile(sys.argv[1])
    # get the output file using the same dimension info as the input file
    outfile = volumeLikeFile(sys.argv[1], sys.argv[2])

    # add one to the data 
    outfile.data = infile.data + 1

    # write out and close the volumes
    outfile.writeFile()
    outfile.closeVolume()
    infile.closeVolume()

程式碼的功能如下。前面的部分是不同模組的匯入 - 唯一非標準的模組是 pyminc.volumes.factory。幾乎所有 pyminc 體積例項的建立都是透過一組工廠方法完成的。它們是

函式	描述
volumeFromFile	從現有檔案開啟 MINC 體積 - 用於讀取現有資料。
volumeLikeFile	從現有檔案建立一個新的 MINC 體積 - 用於寫入資料。
volumeFromInstance	從現有例項（Python 物件）建立一個新的 MINC 體積。
volumeFromDescription	透過指定尺寸、大小、起始位置等來建立一個新的 MINC 體積。

程式碼的下一行將輸出檔案的資料賦值為輸入檔案的資料加 1。每個 pyminc 體積都具有一個數據屬性，它是一個 numpy 陣列。請注意，直到訪問資料屬性時才實際讀取資料。最後的部分將輸出檔案寫入磁碟並關閉這兩個體積。