MINC/VisualTools/Display
Display 是一個功能非常強大的程式，也許最好的解釋方式是透過示例。它的主要用途是分割、視覺化/疊加多個 MINC 檔案以及 3D 物體的視覺化。
這將是一個透過示例概述 Display 中疊加影像的方法。特別是，該示例將顯示 t 統計量圖和滑鼠大腦的最終非線性平均值的疊加。兩個輸入檔案是
我們想要做的是建立一個影像，顯示大腦的哪些區域與特定的 t 統計量相關聯。理想情況下，我們希望使用不同的顏色顯示具有負 t 統計量和正 t 統計量的區域。最終結果應該類似於這樣
您可以將多個檔案載入到 Display 中。在上面的示例中，紅色顯示 t 統計量至少為 4（因此為正）的區域，藍色區域表示 t 統計量最多為 -4 的區域。所有這些資訊都來自一個檔案：tstats.mnc 檔案。為了使用該檔案建立兩種不同的顏色，您需要在 Display 中載入兩次。這是第一步
$ Display final-nlin.mnc tstats.mnc tstats.mnc
Display 中步驟概述
- 點選“空格彈出選單”或按空格鍵進入主選單（如果您尚未在其中）。
- 點選“T 檔案”或按“t”。
- 點選“Y 載入使用者定義 ColCo”或按“y”。
- 在命令列中輸入：“/micehome/jlerch/luts/hotred”並按“回車”。
Display 具有控制面板。您可以用滑鼠點選按鈕，或者使用鍵盤上的按鍵（例如，點選“D 顏色編碼”與按鍵盤上的“d”具有相同的效果）。當您點選“D 顏色編碼”時，您會進入一個選單，允許您將顏色更改為灰色、熱金屬、光譜……嘗試一下，看看它們的效果。在本例中，我們想使用使用者定義的顏色，因此我們需要載入它們。這些是文字檔案，指示顏色條上的哪些點對應哪些顏色。下面是一個示例。如果您進入了 Display 的顏色編碼選項卡，請按空格鍵或“空格彈出選單”返回主選單。在那裡進入“T 檔案”，然後進入“Y 載入使用者定義 ColCo”。一旦您按下了後者，Display 將變得無響應，因為它正在等待來自命令列的輸入。因此，轉到啟動 Display 的 shell。它會顯示
$ Display final-nlin.mnc tstats.mnc tstats.mnc Inputting final-nlin.mnc. Objects input. Inputting tstats.mnc. Objects input. Inputting tstats.mnc. Objects input. Enter name of piecewise colour coding file to load:
在這裡，您可以現在輸入您要使用的查詢表的名稱（並按回車）。
Enter name of piecewise colour coding file to load: /where/the/lookup/table/is/hotred
這就是“熱紅”查詢表應該包含的內容。檔案中的每一行都提供一個區間點及其顏色。最後 3 個數字代表紅色、綠色、藍色（0 = 無，1 = 滿），第一個數字指示該顏色應該出現在區間的哪個位置。在本例中，在區間的開始（0.00）是黑色（0.0 0.0 0.0），這意味著每種顏色都沒有。在中間（0.50）是紅色，帶有一半藍色（1.0 0.0 0.5），在熱紅光譜的末端是白色（1.0 1.0 1.0）。
$ cat /where/the/lookup/table/is/hotred 0.00 0.0 0.0 0.0 0.25 0.5 0.0 0.0 0.50 1.0 0.0 0.5 0.75 1.0 0.5 1.0 1.00 1.0 1.0 1.0
回到 Display 中，您將看到顏色的變化。
Display 中步驟概述
- 點選“空格彈出選單”或按空格鍵進入主選單（如果您尚未在其中）。
- 點選“D 顏色編碼”或按“d”。
- 點選“Z 下顏色：黑色”或按“z”。
- 在命令列中輸入“transparent”並按“回車”。
- 調整 Display 螢幕左側顏色的閾值。
在 Display 中，螢幕左側有一個顏色滑塊，它作用於當前可見層的顏色。在將“下顏色”切換為透明後，您可以將上下顏色的指示器拖動到所需位置。您可以看到，當透明度開啟時，只要您更改可見顏色範圍，下一層（預設情況下為“熱金屬”顏色）就會顯示出來。
到目前為止，我們所做的所有操作都是針對“頂層”，它是 Display 的最後一個引數（在本例中為 tstats.mnc）。我們最初給出的三個引數是 final-nlin.mnc、tstats.mnc 和 tstats.mnc。我們現在將轉到第二層（tstats.mnc）並使用該層來顯示負的 t 統計量值。
Display 中步驟概述
- 點選“空格彈出選單”或按空格鍵進入主選單（如果您尚未在其中）。
- 點選“S 切片檢視”或按“s”。
- 點選“T 當前體積：3”或按“t”。
- 點選“T 當前體積：1”或按“t”（再次，這樣我們現在就在處理第 2 層）。
- 點選“空格彈出選單”或按空格鍵進入主選單。
- 點選“T 檔案”或按“t”。
- 點選“Y 載入使用者定義 ColCo”或按“y”。
- 在命令列中輸入：“/where/the/lookup/table/is/hotblue”並按“回車”。
- 點選“空格彈出選單”或按空格鍵進入主選單。
- 點選“D 顏色編碼”或按“d”。
- 點選“Z 下顏色：黑色”或按“z”。
- 在命令列中輸入“transparent”並按“回車”。
- 調整 Display 螢幕左側顏色的閾值。
這就是 hotblue 檔案應該包含的內容。
$ cat /where/the/lookup/table/is/hotblue 0.00 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.5 0.50 0.0 0.5 1.0 0.75 0.5 1.0 1.0 1.00 1.0 1.0 1.0
在本例中，請確保將顯示範圍的頂部/上端指示器拖動到顯示範圍的底部/下端指示器下方。
我們需要做的最後一件事是更改大腦的顏色（灰色與藍色和紅色搭配起來更好），消除可見的游標，以及使各層的插值看起來更好。
Display 中步驟概述
- 點選“空格彈出選單”或按空格鍵進入主選單（如果您尚未在其中）。
- 點選“S 切片檢視”或按“s”。
- 點選“T 當前體積：2”或按“t”。
- 點選“T 當前體積：3”或按“t”（再次，這樣我們現在就在處理第 1 層）。
- 點選“空格彈出選單”或按空格鍵進入主選單。
- 點選“D 顏色編碼”或按“d”。
- 點選“D 灰色度”或按“d”。
- 點選“空格彈出選單”或按空格鍵進入主選單。
- ### 消除可見的游標 ###
- 點選“F 分割”或按“f”。
- 點選“4 游標可見：開”或按“4”。
- 點選“空格彈出選單”或按空格鍵進入主選單。
- ### 提高插值質量 ###
- 點選“Q 體積配置”或按“q”。
- 點選“S 插值：近鄰”或按“s”。
- （您可以再次按 s，將插值從三線性更改為三立方）
有關更多資訊，請訪問 [麥吉爾大學麥康奈爾腦成像中心網站] 獲取 Display 手冊。