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醫學生理學/基礎生物化學/核酸

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引言與概述

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細胞被分為兩大類,原核細胞真核細胞。基本上,原核細胞沒有細胞核,所有細菌都屬於這一類;真核細胞有細胞核,動物和植物細胞都屬於這一類。兩種細胞的特徵是它們都包含構建完整生物體所需的所有資訊。這些資訊儲存在細胞的DNA中。在原核細胞中,DNA 以環狀形式存在於細胞質中,而在動物中,DNA 存在於細胞核中,並被組織成染色體。兩種型別的 DNA 都被組織成基因。基因是產生蛋白質所需的核酸序列。本節將探討 DNA 和 RNA 的化學性質。

我們將研究核酸和相關化合物的化學結構。我們將只簡要涉及蛋白質合成和複製。我們將在細胞生物學部分更詳細地探討這些內容,特別是在基因表達細胞繁殖部分。

DNA 結構

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一個 DNA 分子由兩條核酸聚合物組成:這些聚合物由連線在一起的核酸鏈組成。因此,存在兩條 DNA 鏈,它們方向相反 - 它們被稱為反平行 - 並且這兩條鏈透過氫鍵連線在一起。(有關詳細資訊,請參見下文)。這些鍵的弱性使得這些鏈可以輕鬆分離以進行復制和製造 RNA。DNA 中存在四種核酸,它們被組合成稱為密碼子的三聯體。每個密碼子對應特定的氨基酸。

DNA 功能

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DNA 控制著整個細胞的功能。儘管每個細胞都包含人體 DNA 的完整副本,但在任何給定細胞中,只有部分 DNA 被表達。表達具有時間和空間特徵,並且還會根據身體的需要而變化。它是透過製造蛋白質來實現的,包括結構蛋白和酶。

                                                 /---->Cell Enzymes------>\
Gene(DNA) --->RNA Formation--->Protein Formation                            ---> Cell Function
                                                 \---->Cell Structure ---->/

DNA 的重要性在於它能夠透過遺傳密碼控制蛋白質的形成。它是透過密碼子來實現的,正如前面提到的,密碼子是三個核酸的三聯體。當收到建立特定蛋白質的訊號時,就會識別相關的 DNA 部分,一種稱為 RNA 聚合酶的酶會導致兩條鏈分離。其中一條鏈的 DNA,稱為轉錄鏈,作為製造信使 RNA (mRNA) 的模板,這個過程稱為轉錄。這條 RNA 鏈包含所有密碼子的映象,每個密碼子代表一個氨基酸。

經過進一步處理後,mRNA 透過膜孔從細胞核中傳遞出來,並附著在核糖體上。另一種形式的 RNA,稱為轉運 RNA (tRNA),然後將氨基酸運送到 mRNA,mRNA 將它們組裝成最初由基因 DNA 決定的多肽序列。這種從 mRNA 鏈製造蛋白質的過程稱為翻譯。蛋白質通常被帶入內質網進行進一步處理。

蛋白質合成

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以下圖示以簡化形式展示了蛋白質合成的過程。有關更多詳細資訊,請參閱細胞生物學部分中關於基因表達的部分。

從 DNA 模板轉錄一條 mRNA 鏈;它在細胞核中進一步修飾;然後它離開細胞核並附著在核糖體上;然後從這條 mRNA 鏈翻譯多肽。這種多肽可以在內質網中進一步修飾。

RNA 轉錄

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此圖示展示了轉錄過程的摘要;


RNA 翻譯

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此圖示展示了翻譯過程的摘要

此圖示展示了 tRNA 將氨基酸運送到 mRNA 模板上

這是一個非常簡單的概述,在我們下一章討論基因表達時會更詳細地探討。

化學和結構

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基本結構

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核苷酸是三種部分組成的分子,它們連線在一起形成DNADeoxyribose Nucleic Acid)或RNARibose Nucleic Acid)聚合物。每個核苷酸是一個由一個或多個磷酸基團組成的三部分分子;一個五碳糖,以及一個稱為鹼基的碳氮環。以下是核酸鳥嘌呤的示意圖


注意核糖環上碳原子的編號。這些核苷酸可以透過它們的磷酸基團連線起來形成 RNA 或 DNA 聚合物。

核苷酸鹼基

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存在五種核苷酸鹼基,它們基於嘧啶或嘌呤模型。嘌呤衍生物具有兩個碳氮環,形成腺嘌呤和鳥嘌呤鹼基。嘧啶衍生物具有一個碳氮環,形成胞嘧啶、胸腺嘧啶和尿嘧啶鹼基。胸腺嘧啶鹼基僅出現在 DNA 分子中,尿嘧啶鹼基出現在 RNA 分子中。

核糖用於 RNA 分子,脫氧核糖用於 DNA 分子

DNA 和 RNA 結構

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DNA 分子

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DNA 分子排列成著名的雙螺旋結構,該結構於 1953 年由沃森和克里克首次提出

DNA 結構

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DNA 由兩條透過氫鍵連線的 DNA 聚合物鏈組成。每條鏈都有一個末端磷酸基團或一個末端核糖基團。具有磷酸基團的末端被稱為 3 質子 - 3' 末端,具有戊糖基團的末端被稱為 5 質子 - 5' 末端。當我們看一下 DNA 和 RNA 複製時,這種區別很重要。

兩條鏈的方向相反,一條從3'到5',另一條從5'到3'。

下面的插圖顯示了單個核酸如何在一條DNA單鏈中連線在一起。


在鏈中,腺嘌呤鹼基總是與胸腺嘧啶鹼基配對,鳥嘌呤鹼基總是與胞嘧啶鹼基配對。

下面的插圖顯示了一條DNA鏈與其反向鏈結合在一起。它們透過氫鍵(虛線)連線在互補的核酸之間。

注意

  • 鳥嘌呤總是胞嘧啶配對。
  • 腺嘌呤總是胸腺嘧啶配對。

記住這個配對方法:"The Audience Goes Crazy"。

  • 胸腺嘧啶和腺嘌呤透過兩個氫鍵連線。
  • 鳥嘌呤和胞嘧啶透過三個氫鍵連線。

這是另一種描述DNA的簡寫方法。

RNA結構

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RNA分子是使用核糖糖形成的。它們不形成螺旋結構。另一個區別是它們沒有胸腺嘧啶鹼基,而是使用尿嘧啶來代替。它們使用DNA模板,並從5'端到3'端形成。這是一個關於DNA螺旋和RNA鏈的結構圖。

核酸一次新增一個,以三磷酸形式新增。首先,核酸與其對應的鹼基配對,然後在3'位的羥基和第一個磷酸基團之間形成酯鍵,並脫落一個焦磷酸。該裂解釋放的能量為反應提供動力。

再次注意,RNA鏈從5'端開始,沿著DNA模板從3'端到5'端延伸。

有許多種型別的RNA

  • 我們剛剛看過的mRNA
  • 在DNA複製過程中很重要的引物RNA
  • 在翻譯過程中將氨基酸運送到mRNA鏈的轉移RNA(tRNA)。
  • 構成核糖體大部分的核糖體RNA。

DNA複製

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這裡,我們對DNA複製進行了簡化的概述,重點強調了化學反應。當我們在細胞生物學部分討論細胞繁殖時,我們將提供更詳細的說明。

當DNA複製時,整個染色體都會複製。由於它包含高達90億個鹼基對,如果複製從一端開始,然後一直進行到另一端,將需要極長的時間。因此,複製在多個位置同時進行。形成氣泡,複製從氣泡的兩端在複製叉處進行。

核苷三磷酸在複製鏈的3'端新增。一種DNA聚合酶(δDNA Poly)促進該反應。

  • 首先,鹼基與其在模板鏈中的對應鹼基配對,形成氫鍵。
  • 接下來,核苷三磷酸的第一個磷酸鍵與3'碳的羥基結合。

從最後兩個磷酸基團中裂解獲得的能量為反應提供動力。

在複製鍊形成期間和之後,各種酶都會檢查轉錄的準確性,並進行必要的修復。這一點,以及複製叉上的眾多活動以及鏈末端的端粒活性,將在細胞複製部分中進行更詳細的討論。

ATP,H+載體和cAMP

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