神經影像資料處理/處理/步驟/丟棄首卷
外觀
EPI序列中第一個 體積 的訊號可能由於縱向磁化尚未達到穩態而超出範圍。因此,它們通常被丟棄,不用於分析。對 體素 時間序列的視覺檢查可以很好地瞭解哪些體積受到影響。
請記住,丟棄首卷將影響掃描中的體積數量以及刺激開始檔案和生理引數檔案中的時間資訊。
3dTcat 是 AFNI 的函式,用於丟棄首卷。它基本上覆制原始資料,省略指定體積。一個簡單的命令看起來類似於以下內容
3dTcat [options] INPUTFILE[2..$]
在本例中,它將原始資料 (inputfile) 中除前兩個體積 (0 和 1) 之外的所有體積寫入輸出檔案。此步驟通常用於將原始資料的 (感興趣部分) 複製到結果目錄以進行進一步預處理,以便原始資料保持不變。請注意,體積編號和時間資訊可能需要相應調整。
3dTcat 也可用於使用 -rlt 選項進行線性去趨勢。有關更多詳細資訊和選項,請檢視手冊頁 [1] 。
在 afni_proc.py 中,這是一個預設步驟,但要移除的 TR 數量設定為 0。移除前 n 個 TR 的相應選項為
-tcat_remove_first_trs n