寶可夢朱/紫/終章
要開始終章，遊戲的重大劇情事件和DLC應該或多或少都已完成。此外，必須透過神秘禮物功能從網際網路下載一個特殊的漿果道具才能玩終章。
完成上述操作後，前往北上町的商店，調查店主右側的雕像。這將啟動終章的劇情。
- 一段過場動畫將播放，引導玩家回到他們在帕底亞的起點，也就是他們的家，並且會播放更多過場動畫。
- 然後玩家將被引導前往梅薩佐拉的大門。
- 從那裡，玩家將前往北上町。
- 從那裡前往凱爾和卡敏的家庭住處，引發出更多過場動畫和劇情介紹。
- 玩家接下來將被引導尋找社群中心電視的遙控器。它隱藏在螢幕右側的花盆裡。
- 玩家將被引導到廣場，這裡開始了DLC的遊戲玩法部分。與遊戲早期的部分相比，它並沒有特別具有挑戰性，但建議在這個部分為你的隊伍準備一個已經治癒並可以戰鬥的隊伍。玩家角色將與凱爾一起，與來自果園的兩名訓練師進行雙人對戰。
- 贏得戰鬥後，玩家應該在需要時在中心治癒，然後跟隨妮莫娜前往節日區。在門口，玩家將遇到凱爾和卡敏的祖父母——雪人與秀子。一段過場動畫將播放，揭示這些奇怪的行為是如何開始的，然後開始一場雙人對戰，玩家角色和凱爾將面對雪人和秀子。同樣，與遊戲早期的戰鬥相比，這場戰鬥也不算什麼，凱爾還有他完整的6只寶可夢隊伍來協助玩家。
| 雪人爺爺的隊伍 | 秀子奶奶的隊伍 |
|---|---|
| 阿柏怪 ♂ - 等級80 | 燭光靈 ♀ - 等級82 |
| 臭臭泥 ♂ - 等級80 | 巨牙鯊 ♀ - 等級82 |
戰鬥結束後，一段過場動畫將播放，阿蘭打電話給玩家，但被切斷了。返回城鎮，一段新的過場動畫將播放。在吃下了從新寶可夢身上掉落的麻糬後，阿蘭和佩妮將開始防禦它。過場動畫結束後，玩家將有機會在寶可夢中心治療隊伍（如果需要），並且可以與阿蘭和佩妮互動，開始與凱爾並肩作戰的雙人對戰。
| 寶可夢訓練師阿蘭 | 寶可夢訓練師佩妮 |
|---|---|
| 貪吃栗鼠 ♂ - 等級82 | 黑夜魔靈 ♂ - 等級84 |
| 鐵甲貝 ♂ - 等級82 | 仙子伊布 ♀ - 等級85 |
| 斗笠菇 ♂ - 等級83 | 葉伊布 ♀ - 等級84 |
這場雙人對戰比終章中的其他對戰更具抵抗力，但與遊戲早期的戰鬥相比，它仍然不算什麼。凱爾帶來了一個完整的6只寶可夢隊伍，所以只要玩家也帶來了一個同樣等級的完整的可以戰鬥的隊伍，並且沒有故意輸掉比賽，失敗的可能性就微乎其微，因為玩家實際上擁有比對手隊伍多兩倍的寶可夢。一段過場動畫將播放，凱爾將追逐著寶可夢穿過果園。如果需要，在寶可夢中心治療，然後繼續前往忠誠廣場入口，在那裡將有一段與妮莫娜的過場動畫相遇。在過場動畫結束時，凱爾會保護玩家免受村民的攻擊，讓玩家可以與妮莫娜進行雙人對戰。遊戲不會強制進行這場戰鬥，所以玩家可以儲存，治療，更換隊伍，或者在需要的時候離開並回來。準備好後，與妮莫娜互動開始戰鬥。
| 如果你一開始選擇了火屬性 | 如果你一開始選擇了水屬性 | 如果你一開始選擇了草屬性 |
|---|---|---|
| 狼人 ♀ - 等級86 | ||
| 巨鉗螳螂 ♀ - 等級86 | ||
| 美納斯 ♀ - 等級86 | ||
| 電擊魔獸 ♂ - 等級86 | ||
| 黏黏寶 ♀ - 等級86 | ||
| 貓頭鷹喵喵 ♂ - 等級87 |
這是終章中最具挑戰性的戰鬥。狼人可以先使用詭計陷阱，懲罰換出寶可夢的行為。巨鉗螳螂將有效地反制先手使用炎帝，它擁有隔音特性，可以抵消火焰之歌。對手隊伍中的大多數成員都有一個對火系超有效的招式，這意味著最好用其他寶可夢先手。擁有龍系或妖精系可以使這場戰鬥更容易。她最後的寶可夢，貓頭鷹喵喵，會變化為黑暗系，抵消了對火的弱點，並且對幽靈繫有優勢，進一步反制了炎帝。
戰鬥結束後，你將有機會治療和儲存。與寶可夢互動，可以選擇挑戰它。在戰鬥中，寶可夢無法被捕捉，所以專注於使用幽靈系招式，它們對對手寶可夢使用的幽靈系和毒系非常有效。它知道影子球和惡作劇之心。當它的生命值完全耗盡時，遊戲會提示玩家捕捉它。考慮選擇一個與之主題相符的球，而不是擔心它的有效性。
捕捉後，寶可夢等級為88，並且知道惡作劇之心、惡意連鎖、影子球和劇毒。
一段過場動畫將播放，結束終章的主要部分。過場動畫結束後，玩家角色將被轉移到社群中心——離開那裡將觸發另一段過場動畫。然後遊戲將玩家送回帕底亞學院的內部大廳，並且可以邀請到藍莓學院俱樂部房間的人數將會增加。