X射線晶體學/簡介
外觀
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X射線晶體學是一種強大的技術,可以用來視覺化蛋白質的結構。X射線照射到晶體上,X射線根據布拉格定律在晶體內的平面上發生衍射。然後可以收集得到的衍射圖樣。衍射圖樣中斑點的 位置提供了有關晶體結構的資訊。然而,並不是所有關於晶體的資訊都由記錄裝置收集,可以測量斑點強度,但相位資訊會丟失,導致相位模糊。有很多技術被用來從晶體中以其他方式提取相位資訊,對於小分子來說,相位可以直接使用帕特森圖來求解,對於更復雜的分子來說,可以採用類似結構的相位,或者可以從異常散射體中提取相位資訊。在所有情況下,都會根據觀察到的結構因子和計算的相位計算模型,然後對模型進行最佳化以使模型擬合數據。
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- Å:埃,距離單位 (1Å = 10nm = 1x10-10m)
- a.s.u.:不對稱單元
- c:真空中光速 (299,792,458 米/秒,或約 3x108m/s)
- CC:相關係數
- CCD:電荷耦合器件
- CCP4: [協作計算機專案 4]
- Cryo:低溫,在 77K 或以下(液氮溫度)
- Da:道爾頓
- EDTA:乙二胺四乙酸
- eV:電子伏特,能量單位,它是一個不受束縛的電子獲得的動能大小
- EXAFS:擴充套件 X 射線吸收精細結構
- FOM:優值
- GUI:圖形使用者介面
- Gy:戈瑞,劑量單位,(1 Gy = 1 J•kg-1)
- h:普朗克常數 (6.626 × 10-34 J•s)
- HEPES:4-(2-羥乙基)-1-哌嗪乙磺酸
- HEWL:雞卵白溶菌酶
- K:開爾文
- kDa:千道爾頓
- keV:千電子伏特
- M:摩爾濃度
- MAD:多波長異常色散
- MIR:多重同構置換
- MIRAS:多重同構置換與異常散射
- MPD:2-甲基-2,4-戊二醇
- MX:大分子晶體學
- NaAc:乙酸鈉
- nm:奈米,距離單位 (1nm = 1x10-9m)
- NMR:核磁共振
- pA:皮安培(電流)
- pdb: [RCSB 蛋白質資料庫]
- PEG:聚乙二醇
- PX:蛋白質晶體學
- RCSB:結構生物資訊學研究協作中心
- RIP:輻射損傷誘導相位
- RIPAS:輻射損傷誘導相位與異常散射
- RMSD:均方根偏差
- SAD:單波長異常色散
- Se-Met:硒代蛋氨酸
- SIR:單重同構置換
- SIRAS:單重同構置換與異常散射
- Tris:Tris(羥甲基)氨基甲烷緩衝液
- v/v:體積比
- w/v:重量比