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生物化學/糖酵解

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糖酵解是葡萄糖被分解成兩個丙酮酸分子的過程。事實上,糖酵解被認為是十個酶介導步驟的線性途徑。糖酵解途徑有兩個階段:能量投資階段和能量生成階段。糖酵解的前五個步驟是能量投資“準備階段”,產生3-磷酸甘油醛。能量生成階段是糖酵解的最後五個步驟,產生最終的兩個丙酮酸分子產物。糖酵解發生在細胞質中,可以在沒有氧氣的情況下進行。在體內,糖酵解的葡萄糖來源來自膳食二糖和單糖。

糖酵解是碳水化合物代謝的第一步,其最終結果是將葡萄糖轉化為二氧化碳和水。當葡萄糖完全氧化為二氧化碳時,大量能量被轉化為ATP

在糖酵解過程中,會生成兩個NADH分子和淨兩個ATP分子(兩個ATP分子用於啟動該途徑,但隨後會合成四個分子)。因此,每個葡萄糖分子轉化為兩個丙酮酸分子,都會淨產生兩個ATP分子。

在這個過程結束時,只有少部分葡萄糖能量被釋放,其餘的潛在能量仍然存在於丙酮酸分子中,丙酮酸分子會被進一步氧化,首先轉化為乙醯輔酶A,然後透過三羧酸迴圈轉化為二氧化碳。從三羧酸迴圈中獲得的NADH和FADH2進入電子傳遞鏈,透過氧化磷酸化產生ATP。因此,有氧降解比無氧代謝效率更高。這就是為什麼有氧機制現在在生物體中更加普遍,但即使在動物的某些生理情況下,無氧途徑仍然發生。

糖酵解是碳水化合物分解代謝的主要途徑,其中六碳糖被分解成三碳化合物,隨後釋放能量,用於將ADP轉化為ATP。糖酵解可以在厭氧(無氧)和有氧條件下進行。

糖酵解是一個10步途徑,將葡萄糖轉化為2個丙酮酸分子。糖酵解的總反應可以寫成一個淨方程式

葡萄糖 + 2ADP + 2NAD+ → 2丙酮酸 + 2ATP + 2NADH

糖酵解酶

  1. 己糖激酶 (HK)
  2. 磷酸葡萄糖異構酶 (PGI)
  3. 磷酸果糖激酶 (PFK)
  4. 醛縮酶 (ALDO)
  5. 磷酸三糖異構酶 (TPI)
  6. 3-磷酸甘油醛脫氫酶 (GAPDH)
  7. 磷酸甘油酸激酶 (PGK)
  8. 磷酸甘油酸變位酶 (PGM)
  9. 烯醇化酶 (ENO)
  10. 丙酮酸激酶 (PK)

糖酵解化合物

  • 葡萄糖
  • 6-磷酸葡萄糖 (G6P)
  • 6-磷酸果糖 (F6P)
  • 1,6-二磷酸果糖 (F1,6BP)
  • 3-磷酸甘油醛 (GADP)
  • 磷酸二羥丙酮 (DHAP)
  • 1,3-二磷酸甘油酸 (1,3PG)
  • 3-磷酸甘油酸 (3PG)
  • 2-磷酸甘油酸 (2PG)
  • 磷酸烯醇丙酮酸 (PEP)
  • 丙酮酸

視覺概述

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階段 I: 能量投資(步驟 1-5)
階段 II: 能量收穫(步驟 6-10)

十步的詳細描述

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步驟 1: 葡萄糖在第 6 個碳處被磷酸化,由葡萄糖激酶 (己糖激酶 IV) 或其他己糖激酶催化

δG0 = -16.7 kJ/mol

進入細胞的葡萄糖只有一個命運:它被典型的激酶反應轉化為 6-磷酸葡萄糖。當葡萄糖被磷酸化時,它就被困在細胞內部,因為第 6 個碳處的磷酸基團推動磷脂膜,因此 6-磷酸葡萄糖甚至不能接近質膜。

ATP 被用作磷酸基團儲存庫。

Mg2+ 被發現是該酶的輔因子。Mg2+ 的存在遮蔽了 ATP 磷酸基團上的電荷。因此,化合物可以更容易地靠近。

在反應中,焦磷酸鍵被斷裂(-7.5 kcal/mole),並形成一個磷酸酯鍵(+3 kcal/mole),導致淨值 -4.0 kcal/mole。因此,可以得出結論,產物(6-磷酸葡萄糖)比反應物(葡萄糖)能量更低。能量更低意味著更穩定。因此,產物比反應物更穩定。這種條件使得反應不可逆。

步驟 2: 6-磷酸葡萄糖的異構化,由磷酸葡萄糖異構酶催化

δG0 = +1.7 kJ/mol

這種轉化是可逆的。透過將 6C 環狀化合物轉化為 5C 環狀化合物,其中包括環狀部分中的氧原子,如在 6C 化合物中所見,它的目的是產生一個能夠被分裂成兩個碳含量相等(3C)化合物的分子。

步驟 3: 第二個磷酸化反應,由磷酸果糖激酶催化

δG0 = -18.5 kJ/mol

在這一步的幫助下,分裂成兩個碳含量相等(3C)的化合物在磷酸基團方面也得到了平衡。

再次,Mg2+ 被發現是該酶的輔因子。它的功能與步驟 1 中所見類似。

這個反應是不可逆的,可以從它的負 δG0 推斷出來。

步驟 4: 分裂成兩個三碳磷酸,由醛縮酶催化

δG0 = +28 kJ/mol

現在,產生了兩個 3C 分子。

步驟 5: 磷酸二羥丙酮的異構化,由磷酸三糖異構酶催化

δG0 = +7.6 kJ/mol

在這一步之後,每個反應都會發生兩次,因為存在 2 個 3-磷酸甘油醛分子用於後續步驟。

步驟 6: 生成 1,3-二磷酸甘油酸,由 3-磷酸甘油醛脫氫酶催化

δG0 = +6.3 kJ/mol

在這裡,目標是插入磷酸基團,該磷酸基團稍後將被轉移到 ADP 以生成 ATP。還會生成 NADH。

步驟 7: 透過底物水平磷酸化生成 3-磷酸甘油酸,由磷酸甘油酸激酶催化

δG0 = -18.8 kJ/mol

第一步是生成 ATP,即步驟 7。

步驟 8: 將磷酸基團從 3-磷酸甘油酸的第 3 個碳轉移到第 2 個碳,由磷酸甘油酸變位酶催化

δG0 = +4.4 kJ/mol

透過這個反應的影響,在 PEP(步驟 8 的產物)中實現了共振。

步驟 9: 合成磷酸烯醇丙酮酸,由烯醇化酶催化

δG0 = +1.7 kJ/mol

發生水的逸出。

步驟 10: 底物水平磷酸化。丙酮酸的合成,由丙酮酸激酶催化

δG0 = -31.4 kJ/mol

產生 ATP。丙酮酸從烯醇式快速非酶促地互變異構為酮式。這是糖酵解的最後一步,也是不可逆步驟之一。

參考文獻

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  • Nelson, D. L., & Cox, M. M. (2008). 糖酵解、糖異生和磷酸戊糖途徑。Lehninger 生化原理,第 4 版,第 521-559 頁。
  • Berg JM, Tymoczko JL, Stryer L. 生化。第 5 版。紐約:W H Freeman;2002 年。第 16 章,糖酵解和糖異生。
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