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生物化學/三羧酸迴圈

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檸檬酸迴圈,也稱為三羧酸迴圈(TCA),是糖類、脂肪和蛋白質氧化進行的代謝途徑。迴圈的組成部分位於真核生物的線粒體基質中。但重要的是要知道,真核生物的細胞質中也包含檸檬酸迴圈酶的胞質異構體。對於原核生物,檸檬酸迴圈元素必須存在於細胞質中。

含有順烏頭酸的檸檬酸迴圈

糖酵解和其他代謝功能獲得的丙酮酸不能直接進入檸檬酸迴圈。丙酮酸在不可逆的方式下透過丙酮酸脫氫酶複合體轉化為乙醯輔酶A。在這個反應結束時,細胞質中的丙酮酸被降解,新形成的乙醯輔酶A被釋放到線粒體中。然後乙醯輔酶A能夠遇到檸檬酸迴圈酶,因為沒有屏障阻止這一事件。

檸檬酸迴圈的第一步反應是乙醯輔酶A 與草醯乙酸縮合合成檸檬酸。第一步具有高度負的 ΔG 值,這是這個步驟不可逆的標誌之一。

第二個反應使用檸檬酸作為底物,生成異檸檬酸。然而,催化該反應的酶透過兩步完成其工作。首先使用檸檬酸,形成順烏頭酸。下一步,順烏頭酸酶被用來生成異檸檬酸。這解釋了酶名稱的來源。在這裡,ΔG 是正的,但反應仍然繼續朝產物方向進行,為什麼?答案是基於勒沙特列原理。根據勒沙特列原理,反應傾向於朝數量減少的方向進行。在這個步驟中,異檸檬酸脫氫酶(下一步的催化劑)對異檸檬酸的消耗導致反應朝產物方向進行。

在第三步中,異檸檬酸透過異檸檬酸脫氫酶轉化為α-酮戊二酸。該反應具有負的 ΔG,因此是不可逆的。

第四步包括α-酮戊二酸在名為α-酮戊二酸脫氫酶的酶的幫助下氧化為琥珀醯輔酶A。第四步被稱為克雷布斯迴圈的最後一個不可逆步驟。

在第五步反應中,可以看到從琥珀醯輔酶A 到琥珀酸的轉變。該步驟是可逆的,但由於勒沙特列原理,它仍然朝產物方向進行。

第六步由一種酶催化,這種酶同時也是TCA迴圈和電子傳遞鏈(ETC)的成員。該酶有兩個名稱,稱為複合體II 和琥珀酸脫氫酶。它使用琥珀酸並釋放延胡索酸。

在第七步中,觀察到延胡索酸轉化為蘋果酸。該反應是可逆的。然而,該步驟中發現的酶具有高度立體特異性,只使用 L-蘋果酸和反式延胡索酸(延胡索酸)作為底物。

第八步是最後一步,蘋果酸氧化為草醯乙酸。

乙醯輔酶A 不是迴圈開始的唯一部位

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檸檬酸迴圈不必從乙醯輔酶A 開始。有一些替代途徑可以加入迴圈。請注意,不同的氨基酸可能使用相同的替代途徑或獨立的途徑來參與迴圈。

克雷布斯迴圈的調節透過調節迴圈中不可逆步驟的酶來實現。但也可以透過調節丙酮酸脫氫酶來控制,因為這種酶為迴圈提供了主要的底物乙醯輔酶A。有關丙酮酸脫氫酶的調節,請查閱生物化學/丙酮酸轉化為乙醯輔酶A頁面。

TCA迴圈的調節發生在迴圈中發現的三個不可逆步驟的酶上。

克雷布斯迴圈的雙重性質

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克雷布斯迴圈既作為合成代謝途徑,也作為分解代謝途徑。這一事件使其成為一個兩棲代謝途徑。如果它們被用作其他化合物的先驅,迴圈如何繼續?答案是補充反應,它們負責補充途徑中間體,並利用 NADP+ 來完成這項任務。

克雷布斯迴圈元素可以作為其他分子的先驅,比如氨基酸和甾醇,這些物質也可以是更大分子和分子複合物的先驅。

參考文獻

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  • Nelson, D. L., Lehninger, A. L., & Cox, M. M. (2008). Lehninger principles of biochemistry.
華夏公益教科書