R 生物統計學/匯入

為什麼選擇 R 進行生物統計學？

與 SPSS、SAS 和 MINITAB 等常用統計軟體包相比，R 更出色，因為它

強大
適用於多種平臺（Mac OS X、Windows、Linux 等）
可程式設計
非商業化
文件齊全

獲取 R/安裝

資料匯入

Wiley 網站上提供的資料集格式包括 CSV、Excel、MINITAB、SAS 和 SPSS。雖然您可以使用 foreign 包將儲存在 Excel、SAS 和 SPSS 中的資料匯入 R，但您應該下載 CSV 格式的資料。這是因為 CSV 在 R 中處理起來最容易。

例如，您想匯入“大型資料集”資料檔案。下載的資料檔案 (LDS_C02_NCBIRTH800.csv)，假設儲存在目錄“/desktop”中，可以使用以下語法將其匯入 R 作為名為“largedataset”的資料框

> largedataset <- read.csv("/Desktop/LDS_C02_NCBIRTH800.csv", header=TRUE,na.strings="NA")

如果您更喜歡使用標準的“點選”方式選擇資料檔案，您可以使用 file.choose() 函式，即

largedataset <- read.csv(file.choose(), header=TRUE,na.strings="NA")

現在，您應該將資料從 CSV 匯入到名為“largedataset”的資料框中。您可以嘗試透過呼叫其名稱來檢視資料框的內容

> largedataset

您可以透過以下方式訪問 largedataset 資料框中的“sex”（在計算機術語中稱為列）變數

largedataset$sex

例如，您想統計 sex 的頻率

> table(largedataset$sex)

您可以附加資料框，以便可以直接呼叫變數

> attach(largedataset)
> table(sex)
> detach() #cancel attaching

基本資料管理

R 被設計為一個分析系統，而不是像 SPSS 這樣的整合環境。與 SPSS 不同，R 沒有像電子表格一樣的環境用於資料輸入。通常情況下，資料使用不同的軟體（例如資料庫、電子表格軟體，如 OO.o Calc）輸入，然後如上所述匯入到 R 中。對於快速的一次性計算，您可以在 R 中進行資料輸入。例如，如果您想計算十名患者的平均年齡（30、31、32、34、35、36、37、30、40、45），您可以使用 c() 函式將資料輸入 R 中。

> pt_age <- c(30,31,32,34,35,36,37,30,40,45)

您可以透過其名稱呼叫新建立的物件 pt_age...

> pt_age

...然後計算十名患者的平均年齡。

> mean (pt_age)