R 語言生物統計學

Wayne W. Daniel 的《生物統計學》（ISBN：9780471456544）是全球許多 生物統計學 課程的標準教科書。與其他類似主題的書籍類似，Daniel 書中給出的統計計算示例沒有涵蓋 R。（即使它在 MINITAB、SAS 和 SPSS 中給出了示例）由於生物統計學是行業，統計軟體包只是工具，人們應該相信 Daniel 書中的所有示例都可以用 R 重寫。R 作為 S 語言 的免費開源直譯器，理應在 Daniel 的書中和整個生物統計學領域中佔有一席之地。

這本華夏公益教科書是 Daniel 書籍第十版的配套教材。資料集可從 Wiley 網站 下載。將這些資料集匯入 R 的說明將在第 2 章中介紹。

從第 3 章到第 17 章，這本配套教材的內容完全遵循 Wayne W. Daniel 的書籍。每章都以 Wayne W. Daniel 的《生物統計學》（ISBN：9780471456544）中公式的摘要及其在 R 程式設計中的表達開始。各章的節也遵循 Daniel 書籍的內容，包括 Daniel 書籍中的示例和練習以及 R 程式設計中的方向。沒有示例和練習的部分將不再討論。

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• 這是一個維基專案——一個開源的免費訪問參考書。任何人都歡迎並鼓勵隨時貢獻任何內容（只要它與 R 語言生物統計學相關）。
• Hanjin Deviasse 加拿大安大略省多倫多

目錄

作者

1. R 語言簡介
   1. R 語言的第一步
   2. R 語言中的資料型別和基本函式
   3. R 程式設計用於編寫函式
   4. R 語言中的基本圖形
2. R 語言中的資料匯入
3. 生物統計學導論
4. 描述性統計：R 語言公式摘要
   1. 有序陣列
   2. 分組資料：頻率分佈
   3. 描述性統計：集中趨勢度量
   4. 描述性統計：離散程度度量
   5. 複習問題和練習
5. 一些基本機率概念：R 語言公式摘要
   1. 計算事件的機率
   2. 貝葉斯定理、篩查測試敏感性、特異性以及預測值陽性和陰性
   3. 複習問題和練習
6. 機率分佈：R 語言公式摘要
   1. 離散變數的機率分佈
   2. 二項分佈
   3. 泊松分佈
   4. 連續機率分佈
   5. 正態分佈
   6. 正態分佈應用
   7. 複習問題和練習
7. 一些重要的抽樣分佈：R 語言公式摘要
   1. 樣本均值的分佈
   2. 兩個樣本均值之差的分佈
   3. 樣本比例的分佈
   4. 兩個樣本比例之差的分佈
   5. 複習問題和練習
8. 估計：R 語言公式摘要
   1. 總體均值的置信區間
   2. t 分佈
   3. 兩個總體均值之差的置信區間
   4. 總體比例的置信區間
   5. 兩個總體比例之差的置信區間
   6. 估計均值所需的樣本量確定
   7. 估計比例所需的樣本量確定
   8. 正態分佈總體的方差置信區間
   9. 兩個正態分佈總體方差比率的置信區間
   10. 複習問題和練習
9. 假設檢驗：R 語言公式摘要
   1. 假設檢驗：單個總體均值
   2. 假設檢驗：兩個總體均值之差
   3. 配對比較
   4. 假設檢驗：單個總體比例
   5. 假設檢驗：兩個總體比例之差
   6. 假設檢驗：單個總體方差
   7. 假設檢驗：兩個總體方差的比率
   8. 第二類錯誤和檢驗功效
   9. 確定控制第二類錯誤的樣本量
   10. 複習問題和練習
10. 方差分析：R 語言公式摘要
    1. 完全隨機化設計
    2. 隨機化完全區組設計
    3. 重複測量設計
    4. 析因實驗
    5. 複習問題和練習
11. 簡單線性迴歸和相關性：R 語言公式摘要
    1. 迴歸模型
    2. 樣本回歸方程
    3. 評估迴歸方程
    4. 使用迴歸方程
    5. 相關性模型
    6. 相關係數
    7. 一些注意事項
    8. 複習問題和練習
12. 多元迴歸和相關性：R 語言公式摘要
    1. 多元線性迴歸模型
    2. 獲得多元迴歸方程
    3. 評估多元迴歸方程
    4. 使用多元迴歸方程
    5. 多元相關性模型
    6. 複習問題和練習
13. 迴歸分析：一些額外的技術：R 語言公式摘要
    1. 定性自變數
    2. 變數選擇程式
    3. 邏輯迴歸
    4. 複習問題和練習
14. 卡方分佈和頻率分析：R 語言公式摘要
    1. 卡方分佈的數學性質
    2. 擬合優度檢驗
    3. 獨立性檢驗
    4. 同質性檢驗
    5. 費舍爾精確檢驗
    6. 相對風險、優勢比和 Mantel–Haenszel 統計量
    7. 複習問題和練習
15. 非引數和無分佈統計：R 語言公式摘要
    1. 測量量表
    2. 符號檢驗
    3. 用於位置的 Wilcoxon 符號秩檢驗
    4. 中位數檢驗
    5. Mann–Whitney 檢驗
    6. Kolmogorov–Smirnov 擬合優度檢驗
    7. Kruskal–Wallis 秩和單因素方差分析
    8. Friedman 秩和雙因素方差分析
    9. 斯皮爾曼秩相關係數
    10. 非引數迴歸分析
    11. 複習問題和練習
16. 生存分析：R 語言公式摘要
    1. 事件時間資料和刪失
    2. Kaplan–Meier 程式
    3. 比較生存曲線
    4. Cox 迴歸：比例風險模型
    5. 複習問題和練習
17. 人口統計：R 語言公式摘要
    1. 死亡率和死亡比
    2. 生育率度量
    3. 發病率度量
    4. 複習問題和練習
18. 進一步閱讀