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MINC/工具

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MINC工具文件

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MINC有很多附加工具,這裡試圖將所有這些工具的文件整合到一個連貫的地方。有很多文件!這些工具被組織成粗略的章節,你可以隨意在這裡新增你自己的工具,並在需要時新增章節。注意,所有這些工具的原始碼都可以在這裡獲得: http://packages.bic.mni.mcgill.ca/tgz 這些軟體包中至少大部分也會在 http://packages.bic.mni.mcgill.ca/ 上提供二進位制版本。

配準(對齊)

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配準是一個將兩張(或更多張)影像彼此對齊的過程。有很多方法可以做到這一點,但大多數方法都涉及某種形式的梯度下降和匹配演算法。

mni autoreg - 由 Louis Collins 編寫的配準框架

強度校正

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MRI中的強度校正通常是指對B1場效應的校正,但也有在同一受試者的不同掃描之間,甚至不同受試者之間進行強度校正的情況。單個採集的切片之間也可能存在強度差異。

iNormalize 由 Alex Zijdenbos 開發的全域性強度校正軟體包

N3 - 由 John G. Sled 編寫的強度非均勻性校正軟體包

幾何畸變校正

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MRI掃描器會由於多種因素引入幾何畸變。

DistortionCorrection - 用於校正由成像梯度非線性引起的解剖影像畸變的工具。

這些庫是為了擴充套件MINC的功能而編寫的,通常它們會為MINC新增某些功能,比如與影像顯示庫的連結。

bicpl - BIC“程式設計師”庫

EBTKS - 除非廚房裡的水槽,無所不包

bicInventor - 一個膠合庫,允許在MINC程式中使用Inventor/Coin

虛擬機器

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可以在 https://github.com/cobralab/MINC-VM 上找到一個包含預安裝並可直接使用的MINC工具的虛擬機器。

其他語言介面

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emma - 一個古老、老舊且沒有維護的MATLAB介面(由奧斯卡獎得主編寫!)

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