MINC/工具
MINC有很多附加工具,這裡試圖將所有這些工具的文件整合到一個連貫的地方。有很多文件!這些工具被組織成粗略的章節,你可以隨意在這裡新增你自己的工具,並在需要時新增章節。注意,所有這些工具的原始碼都可以在這裡獲得: http://packages.bic.mni.mcgill.ca/tgz 這些軟體包中至少大部分也會在 http://packages.bic.mni.mcgill.ca/ 上提供二進位制版本。
配準是一個將兩張(或更多張)影像彼此對齊的過程。有很多方法可以做到這一點,但大多數方法都涉及某種形式的梯度下降和匹配演算法。
mni autoreg - 由 Louis Collins 編寫的配準框架
MRI中的強度校正通常是指對B1場效應的校正,但也有在同一受試者的不同掃描之間,甚至不同受試者之間進行強度校正的情況。單個採集的切片之間也可能存在強度差異。
iNormalize 由 Alex Zijdenbos 開發的全域性強度校正軟體包
N3 - 由 John G. Sled 編寫的強度非均勻性校正軟體包
MRI掃描器會由於多種因素引入幾何畸變。
DistortionCorrection - 用於校正由成像梯度非線性引起的解剖影像畸變的工具。
這些庫是為了擴充套件MINC的功能而編寫的,通常它們會為MINC新增某些功能,比如與影像顯示庫的連結。
bicpl - BIC“程式設計師”庫
EBTKS - 除非廚房裡的水槽,無所不包
bicInventor - 一個膠合庫,允許在MINC程式中使用Inventor/Coin
可以在 https://github.com/cobralab/MINC-VM 上找到一個包含預安裝並可直接使用的MINC工具的虛擬機器。
emma - 一個古老、老舊且沒有維護的MATLAB介面(由奧斯卡獎得主編寫!)