蛋白質組學/蛋白質 - 蛋白質相互作用
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章節由 Poulami Barman 和 Sarah Allen 編輯和更新
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介紹
蛋白質相互作用對於每個生物體都是至關重要的。大多數蛋白質透過與其他分子的相互作用發揮作用，並且通常與其他蛋白質相互作用。酶與其底物相互作用，抑制劑與其酶相互作用，轉運蛋白與其結構蛋白相互作用，激素與其受體相互作用 - 這些只是在細胞中發生的眾多相互作用中的一部分。一些蛋白質由多個多肽鏈組成，不同肽之間的相互作用對於整個蛋白質的功能是必要的。由於它們非常重要，蛋白質-蛋白質相互作用是科學家需要了解的重要主題。
蛋白質-蛋白質相互作用的許多特徵很重要。顯然，瞭解哪些蛋白質正在相互作用很重要。在許多實驗和計算研究中，重點是兩種不同蛋白質之間的相互作用。但是，你可以有一個蛋白質與自身的其他複製相互作用（寡聚化），或者三個或更多不同的蛋白質相互作用。相互作用的化學計量也很重要 - 也就是說，在給定的反應中存在多少種每種蛋白質。一些蛋白質相互作用比其他蛋白質相互作用更強，因為它們結合在一起更緊密。結合強度稱為親和力。蛋白質只有在能量上有利的情況下才會自發地相互結合。能量在結合過程中發生變化是蛋白質相互作用的另一個重要方面。許多預測相互作用的計算工具都是基於相互作用的能量。
近年來，人們越來越關注在計算上預測蛋白質相互作用。預測相互作用可以幫助科學家預測細胞中的途徑、潛在的藥物和抗生素以及蛋白質的功能。然而，破譯這些相互作用一直是一個持續的挑戰。蛋白質是大型分子，它們之間的結合通常涉及許多原子和各種相互作用型別，包括氫鍵、疏水相互作用、鹽橋等等。蛋白質也是動態的，它們的許多鍵能夠伸展和旋轉，從而導致不同的構象。因此，預測蛋白質-蛋白質相互作用需要對相互作用中涉及的化學和物理學有很好的瞭解。
本章討論了蛋白質-蛋白質相互作用的特徵，它們是如何透過實驗確定的，以及它們是如何透過計算預測的。它還包含一個數據庫列表，您可以在其中探索已知和預測的蛋白質相互作用。上面的連結將引導您到各個部分。