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蛋白質組學/蛋白質分離- 電泳/什麼是電泳?

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凝膠電泳

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凝膠電泳是一種分離技術,用於根據大小、電荷和其他物理性質分離大分子,如核酸或蛋白質。它可以在一維、二維或毛細管中進行。樣品與緩衝液混合,然後在凝膠上執行。電泳分離通常在瓊脂糖或聚丙烯醯胺製成的凝膠上進行。這些凝膠是化學惰性的,因此它們對分子的干擾很小。電泳完成後,對凝膠進行染色,使蛋白質可見。常用的染料包括考馬斯亮藍或銀染色。這種蛋白質分離和鑑定的方法很有用,因為只需要很少的蛋白質就可以確定蛋白質的差異。當用考馬斯亮藍染色時,可以用少至 0.1 毫克的蛋白質發現不同的斑點,當銀染色時,甚至可以用更少的蛋白質(0.02 毫克)發現不同的斑點。其他染色方法包括熒光染料、鋅或銅染色。這種技術的缺點是,它很耗時,並且蛋白質樣品的純度會影響結果。

  • 十二烷基硫酸鈉聚丙烯醯胺凝膠電泳 (SDS-PAGE) - 這種方法根據分子的質量進行分離。十二烷基硫酸鈉 (SDS) 是一種去汙劑,它可以破壞蛋白質之間的相互作用。蛋白質溶解在 SDS 中,然後進行電泳。最小的分子移動得最快,而較大的分子移動得較慢,導致條帶更靠近凝膠的頂部。
  • 等電聚焦 (IEF) - 這種方法根據蛋白質的等電點 (pI) 進行分離。等電點是指蛋白質不帶淨電荷時的 pH 值。蛋白質樣品應用於固定化 pH 梯度 (IPG) 條帶。IPG 條帶可在不同的長度和 pH 範圍內使用。隨著樣品的電泳,蛋白質將根據其電荷遷移到陽極或陰極。蛋白質到達其各自的 pI 時就會停止,這會導致一個條帶。條帶對應於一種蛋白質。

二維電泳是一種將一維分析中列出的兩種方法結合起來的技術。它是一種非常有效的蛋白質分離技術。蛋白質樣品首先在 IPG 條帶上執行,然後到達完成後,將其放置在水平或垂直 SDS 凝膠中。這種技術會導致含有斑點的凝膠。凝膠上的每個斑點對應於不同的蛋白質。然後用與一維分析類似的方法對凝膠進行染色。二維電泳被廣泛使用,並且它的某些方法可以與質譜法結合使用,以鑑定蛋白質。

毛細管

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毛細管電泳與一維或二維電泳非常相似,只是它是在毛細管的小空間內進行的。這在很多方面都是有利的。由於平板凝膠上的高電壓負荷而發生的加熱會對蛋白質的分離產生負面影響,而使用毛細管可以減少這種熱量的積聚。此外,由於凝膠不需要處理,因此可以使用液體聚合物進行分離,並且可以在執行之間更換。這種技術也更容易實現自動化,從而縮短時間並獲得可重複的結果。

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