蛋白質組學/蛋白質分離 - 離心/差速離心
差速離心 是一個涉及多個離心步驟的過程，每次離心速度都會增加，用於分離細胞材料。此過程使用平衡密度梯度。細胞材料的混合物（稱為勻漿）根據每種型別分子的分子量、大小和形狀分離成不同的層。後續的離心輪次將首先沉澱核，其次是線粒體，然後是溶酶體，最後是微粒體。勻漿的可溶性組分是在這些物質被去除後剩下的部分。為了開始專注於在各種差速組分中發現的蛋白質的蛋白質組學研究，首先需要分離和收集該特定層，然後可以進行進一步的純化/實驗。可在http://www.westernblotting.org/protocol%20membrane%20extraction.htm 找到使用不同速度的多輪離心進行膜蛋白提取的方案。
獲得的每個組分都是部分純化的製劑，可以從中透過重複洗滌去除汙染的顆粒。這是透過首先將沉澱物重新懸浮在等滲溶劑中，然後使用離心重新沉澱來實現的。為了進一步純化樣品，然後可以使用密度梯度離心進行分離。
勻漿的核組分可以透過以600g離心10分鐘來沉澱。該組分將包含在細胞核中發現的所有物質，包括基因組DNA、參與複製和轉錄的蛋白質，以及其他核蛋白和物質。
當以5000g離心10分鐘後，勻漿的線粒體組分在沉澱物中獲得。線粒體有時被稱為細胞的“動力源”，因為它們在能量產生中的作用。線粒體也有自己的DNA，與細胞核中發現的DNA不同。線上粒體中發現的感興趣的蛋白質將是那些參與透過氧化磷酸化將有機物質轉化為ATP的蛋白質。
可以透過以12,000xg離心5分鐘來沉澱溶酶體組分。溶酶體包含分解細胞廢物的關鍵蛋白質。
當以50,000g離心60分鐘後，微粒體組分是產生的沉澱物。微粒體是由生物膜包圍的小囊泡。在離心過程中，內質網被片段化為微粒體。
勻漿的可溶性組分是在其他物質在以前的離心輪次中被沉澱出來後剩下的上清液。在此組分中發現可溶性蛋白質。為了進一步分離/純化此處發現的蛋白質，可以使用不同的離心方法，例如密度梯度離心。事實上，密度梯度離心可以用於進一步分離透過差速離心收集的任何組分。
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