結構生物化學/羧肽酶

羧肽酶是一種胰腺酶，催化蛋白質和肽羧基末端的肽鍵水解，對具有芳香族或支鏈脂肪族側鏈的氨基酸具有強烈的偏好。鋅離子透過兩個組氨酸氮、來自穀氨酸羧基的兩個氧和一個水分子，以 5 配位方式結合。蛋白質結構中的一個口袋容納底物的側鏈。證據表明底物的負羧基與酶上的精氨酸形成氫鍵，而鋅與肽羰基的氧原子形成鍵。Zn-OH 或 Zn-OH₂ 組合似乎是與羰基碳反應的基團，在酶的穀氨酸羧基的協助下，將 H⁺ 從結合的水轉移到氨基酸產物。已經制備了一種人工肽酶模型化合物，其中 Cu(II) 由鏈中的四個氮原子結合，鏈末端為胍離子，所有這些都連線到交聯的聚苯乙烯。對帶有羧基的醯胺的水解具有很高的催化活性，類似於羧肽酶活性。胍基上的 H⁺ 可以與羧基形成氫鍵，將底物固定在靠近 Cu 的位置，Cu 是活性位點。