結構生物化學

結構生物化學是生命科學的一個分支，特別是生物化學，它結合了生物學、物理學和化學來研究生物體，並總結所有生命形式共享的一些共同的物理化學基礎原理。它也被更廣泛地稱為結構生物學。結構生物化學家旨在以原子精度級別，分子術語來描述所有生物體所有代謝共享的結構、機制和化學過程，提供所有生命形式以其多樣化形式存在的組織原則。

結構生物化學與其他科學的關係

物理學

1. 熱力學
   1. 熱力學第零定律
   2. 熱力學第一定律
   3. 熱力學第二定律
      1. 熱力學迴圈
   4. 熱力學第三定律
   5. 內能
   6. 熵
   7. 焓
   8. 熱容
   9. 自由能
   10. 物質平衡
   11. 相圖
   12. 相平衡
   13. 吸能反應
   14. 放能反應
   15. 分子熱力學
   16. 熱力學平衡
   17. 理想氣體
   18. 理想氣體過程計算方程
   19. 不可逆過程
   20. 維裡方程的應用
2. 生物能量學
3. 化學反應中的能量耦合
4. 代謝
   1. 合成代謝
   2. 分解代謝
5. 生物物理學 - 單分子技術

化學

1. 化學鍵
   1. 共價鍵
   2. 非共價鍵
   3. 氫鍵
   4. 疏水相互作用
   5. 範德華相互作用
   6. 偶極相互作用
   7. 離子相互作用
   8. 二硫鍵
      1. 形成二硫鍵的多種方法
   9. 電子結構理論
2. 生化自然選擇
   1. 電子結構理論
3. 有機化學
   1. 有機官能團
      1. 羥基
      2. 羰基
      3. 羧基
      4. 氨基
      5. 醯胺
      6. 巰基
      7. 磷酸酯
   2. 有機合成
   3. 大分子型別
      1. 碳水化合物
      2. 核酸
      3. 脂類
      4. 蛋白質
   4. 試劑
   5. 有機分子機制
   6. 有機分子的立體化學
   7. 生物化學中重要有機分子的化學
      1. 維生素和輔因子
      2. 維生素D
      3. 維生素K
      4. 維生素C
      5. 維生素A
      6. 維生素E
      7. 維生素B
         1. 維生素B12
         2. 維生素B6
   8. 生物化學中重要的有機反應
      1. 肽鍵
   9. 有機化學技術
      1. 分離和分離方法
      2. 純化方法
      3. 鑑定方法
      4. 燃燒分析方法
      5. 費歇爾酯化反應
      6. 酯交換反應
   10. 有機化學術語
   11. 合成
   12. 有機金屬化學
       1. 生物有機金屬化學
   13. 不飽和度
   14. 酸鹼化學
4. 無機化學
   1. 金屬
      1. 鹼金屬
      2. 鹼土金屬
      3. 過渡金屬
      4. 貧金屬
      5. 稀土金屬
      6. 金屬離子的生物學作用
      7. 氧化態
      8. 銅金屬伴侶蛋白
      9. 金屬的生物修復
   2. 準金屬/類金屬
      1. 多孔矽的介紹
      2. 碳奈米材料
   3. 非金屬
      1. 鹵素
      2. 惰性氣體
   4. 原子軌道的線性組合
   5. 分子軌道
   6. 如何構建分子軌道圖
   7. 化簡公式和投影算符
5. 點群
6. 特徵表
7. SALC
8. 化學反應
   1. 速率定律
   2. 動力學和熱力學控制
   3. 反應型別
9. 分子幾何
10. 週期性趨勢
    1. 原子半徑
    2. 電子親和力
    3. 電負性
    4. 電離能
    5. 金屬行為
    6. 熔點
11. 藥物化學
12. 晶體固態
    1. 公式和結構
13. 普通化學
    1. 有效數字
    2. 物質

生物學

1. 生物體的特性
2. 類維生素A

進化

1. 地球的歷史
2. RNA世界假說
3. 實驗室進化
4. 人類的進化
5. 種群的進化
6. 奧巴林-霍爾丹假說
7. 分子進化
8. 生命的三域
   1. 古菌
      1. 古菌中的SAMPylation蛋白
   2. 細菌
   3. 真核生物
      1. 群落生態學
9. 內共生學說
10. 膜的進化
11. 鋁和矽的自然選擇
12. 物種形成
13. 基因流動
14. 生物學和進化生物學
15. 哈代-溫伯格原理

細胞

1. 細胞器和結構生物化學
   1. 細胞核
   2. 核仁
   3. 核糖體
      1. 核糖體合成
      2. 成熟
      3. RNP
   4. 葉綠體
   5. 蛋白質
   6. 內質網
      1. 內質網應激與2型糖尿病
   7. 高爾基體
   8. 線粒體
      1. 心磷脂和線粒體
   9. 中心體
   10. 胞質溶膠
   11. 溶酶體
   12. 過氧化物酶體
   13. 細胞骨架
   14. 真核細胞器的功能類別
   15. 植物細胞
       1. 熱應激反應
       2. 纖維體
   16. 動物細胞
       1. 膜接觸位點
   17. 用X射線成像細胞結構
   18. 熒光
   19. 細胞衰老
   20. 細胞粘附
2. 原核生物和真核生物
   1. CRISPR防禦系統（原核生物）
   2. 原核生物基因表達的控制
   3. 真核生物基因表達的控制
   4. 真核生物可變剪接
   5. 真核生物中的金屬含量
3. 幹細胞
   1. 胚胎幹細胞
   2. 成體幹細胞
4. 細胞轉化能量
   1. 代謝耦合反應
   2. ATP
   3. 乙醯輔酶A
   4. 糖酵解和糖異生
      1. 無氧呼吸（發酵）
      2. 有氧呼吸
      3. 丙酮酸脫氫酶複合體
      4. 三羧酸迴圈（檸檬酸迴圈）
      5. 氧化磷酸化迴圈（電子傳遞鏈迴圈）
      6. 糖異生
      7. 磷酸果糖激酶-1
         1. 微量純化
   5. 光反應
   6. 卡爾文迴圈
   7. 戊糖磷酸途徑
5. 控制系統
   1. 神經系統
      1. 帕金森病
   2. 迴圈系統
   3. 排洩系統
   4. 呼吸系統
      1. 哮喘/哮喘症狀
   5. 消化系統
      1. 乳糖不耐受
      2. 克羅恩病
      3. 肝硬化
   6. 肌肉系統
   7. 內分泌系統
      1. 卵巢癌
      2. 甲狀腺機能亢進症
      3. 艾迪生病
   8. 感覺系統
      1. 視覺的生化途徑
   9. 免疫系統
   10. 皮膚系統
   11. 生殖系統
6. 細胞訊號通路
   1. 旁分泌訊號
   2. 自分泌訊號
   3. 內分泌訊號
   4. G蛋白和G蛋白偶聯受體
   5. 腺苷酸環化酶和cAMP訊號傳導
   6. 磷酸肌醇訊號傳導
   7. 鈣訊號傳導
   8. 蛋白激酶訊號級聯
   9. 受體酪氨酸激酶
   10. 激酶抑制劑
       1. MPS1蛋白激酶抑制劑開發
   11. 胰島素訊號傳導
   12. 表皮生長因子訊號傳導
   13. RAS
   14. ROS
   15. 導致癌症的訊號傳導問題
   16. 轉化生長因子β
   17. 激素訊號傳導
   18. 細胞凋亡
   19. RAGE：模式識別受體
   20. 移動鋅和一氧化氮
   21. 一氧化氮
   22. 硫酸肝素
   23. 骨骼肌重塑
   24. 吞噬凋亡
   25. 壞死
   26. 訊號傳導中的噪聲
   27. Hippo訊號傳導
   28. JNK訊號傳導
   29. 免疫訊號傳導
       1. RIG-I樣受體（RLR）
       2. NOD樣受體（NLR）
       3. IL23R
   30. 細胞凋亡誘導因子
   31. 脂肪生成：從幹細胞到脂肪細胞
   32. 一氧化氮和cGMP反應
7. 分泌蛋白
8. 顯微鏡
9. 內吞作用
   1. 內吞作用期間的肌動蛋白組裝
10. 病毒透過內吞作用進入
11. 有絲分裂紡錘體
12. 菌毛
    1. IV型菌毛
13. 鞭毛
14. 衰老和代謝控制分析
15. 短線性基序和病毒感染
16. 吞噬作用
17. 胞飲作用
18. 細胞因子受體
19. Ras-ERK和PI3K-mTOR通路

遺傳學

1. 細菌的遺傳學
2. 突變等位基因的特性
3. 遺傳學的基礎
4. 遺傳學術語
5. 遺傳模式
6. 染色體
7. 表觀基因組學
   1. 表觀基因組閱讀器
8. 有絲分裂
9. 減數分裂
10. 同源框基因
11. 如何知道細胞中的基因是“開啟”還是“關閉”？
12. 遺傳變異
13. 結構變異

癌症生物學

1. DNA修復缺陷
2. 癌症分類
   1. 癌
   2. 肉瘤
   3. 淋巴瘤
   4. 白血病
   5. 生殖細胞腫瘤
   6. 母細胞瘤
3. 誘變
   1. 埃姆斯試驗
4. 腫瘤抑制基因
   1. PTEN
   2. p53
   3. p63
   4. p73
   5. sequestosome-1
   6. 視網膜母細胞瘤
   7. p62
   8. Brooke-Spiegler綜合徵
5. 癌症中的谷氨醯胺成癮
6. 配體結合位點和穀氨酸受體運輸
7. 原癌基因

藥物設計與醫藥

1. 藥物靶點
2. 量子點-適體偶聯物
3. 藥物劑型
   1. 固體劑型
   2. 液體劑型
   3. 外用劑型
   4. 眼用劑型
   5. 其他劑型
4. 藥物平臺
5. 藥物分類
6. 藥物開發挑戰
7. 扎那米韋和奧司他韋的開發和發現用於各種疾病
8. 藥物臨床開發
9. 管制藥物法案
10. 天然產物的貢獻
11. 藥物如何穿過細胞膜
12. MDR 泵
13. 對藥物的反應
14. 流感病毒
15. 阿普唑侖
16. 氨甲喋呤
17. 阿司匹林
18. 纈沙坦
19. 強力壯
20. 泰諾
21. 百憂解
22. 炭疽
23. 苯乙肼
24. 法莫替丁
25. 硝苯地平
26. 伊馬替尼
27. 魯沃
28. 炔諾酮
29. 紫杉醇
30. 非索非那定
31. 阿德拉
32. 利他能
33. 帕羅西汀
34. 帕辛
35. 大麻
36. 苯海拉明
37. 潑尼松
38. 菸草和尼古丁
39. 酒精
40. 對乙醯氨基酚
41. 維柯丁
42. 葉酸
43. 亞胡斯卡
44. 偉哥（西地那非枸櫞酸鹽）
45. 利他能
46. 逆轉錄酶抑制劑/AZT
47. 藥物拮抗劑
48. 酪氨酸激酶抑制劑
49. 耐藥性
50. 抗病毒藥物
51. 氯胺酮
52. 搖頭丸
53. 可卡因
54. 華法林
55. 布洛芬
56. 氯雷他定
57. 耐信
58. 甲氨蝶呤
59. 萬古黴素
60. 沙利度胺
61. 辛伐他汀
62. 大腦中的藥物獎賞通路
63. 赫勒氏綜合徵及其治療方法
64. 基於 RNA 的藥物
65. 抗生素
66. 前藥
67. 選擇性 serotonin 再攝取抑制劑
68. 藥物透過身體的階段
69. 他汀類藥物
70. 咖啡因
71. 麥角酸二乙醯胺
72. 甲基苯丙胺
73. 米諾環素
74. 睪酮和合成代謝-雄激素類固醇 (AASs)
75. 羥考酮
76. 避孕藥
77. 嗎啡
78. 異丙酚
79. 利妥昔單抗
80. 緊急避孕藥
81. 藥物給藥途徑
    1. 外用
       1. 經皮
       2. 滴眼液
       3. 吸入
       4. 鼻腔給藥
    2. 腸內
       1. 口服
       2. 直腸
       3. 舌下
    3. 腸外
       1. 靜脈注射
       2. 肌肉注射
       3. 皮下注射
       4. 動脈內注射
       5. 皮內注射
       6. 透皮
       7. 黏膜
       8. 吸入
82. 藥代動力學
83. PTP1B
84. 安非他明
85. 保幼激素
86. 苯丙酮尿症 (PKU)
87. 抗生素
88. 呋塞米
89. 維生素C
90. 藍肽
91. ADME
92. 藥理學

實驗室與臨床的關係

1. 轉化科學
   1. 糖尿病
   2. 阿爾茨海默病
2. 個體化醫療
3. 模式生物
4. 彌合基礎研究和臨床研究之間的差距

組織學

1. 染色型別
   1. 蘇木精-伊紅染色

神經科學

1. 神經元
   1. 動作電位
   2. 靜息電位
   3. 神經元內的訊號傳導
2. 神經膠質細胞
3. 神經化學
   1. 神經遞質
4. 軸突運輸和疾病
   1. 多發性硬化症
5. 突觸
6. 通道病
7. 大腦發育階段
   1. 神經誘導
   2. 增殖
   3. 遷移
   4. 分化
   5. 突觸發生
   6. 細胞死亡/穩定
   7. 突觸重排
8. 神經退行性疾病
9. 神經珠蛋白
10. 運動系統
    1. 基底神經節
    2. 小腦

系統生物學

1. 程式性細胞死亡分析

生物資訊學

1. 同源性
2. 序列比對
3. 結構比對
4. 蛋白質結構比對的進展和缺陷
   1. 用於結構比對的程式
      1. DALI
      2. 組合延伸
      3. SSAP
      4. GANGSTA+
      5. MAMMOTH
      6. RAPIDO
      7. SABERTOOTH
      8. TOPOFIT
   2. RNA 結構比對
5. 進化樹
6. 生物成像
7. 組合化學
8. 比較基因組學
9. 轉基因動物
   1. 監管
10. 蛋白質摺疊識別
11. SIRCh 生物資訊學連結（精選網際網路資源）
12. Fold.it

分子建模

1. 分子對接
2. 經典分子動力學
3. PDF 中的互動式 3D 模型

思維慣性

1. 錯誤建立的結果
2. 對機制作用的錯誤理解

水

1. 獨特特性
2. pH 值
3. 緩衝液
4. 滲透
5. 極性
6. 水氣反應

蛋白質

1. 氨基酸
   1. D-酶的全部化學合成：HIV-1 蛋白酶的對映異構體顯示了互補手性底物特異性的證明
   2. 固氮
   3. 氨基酸降解
   4. 氨基酸生物合成
   5. 蛋白質/瞭解阿爾茨海默病 β-澱粉樣蛋白結構的最新進展
2. 蛋白質
   1. 結構
   2. 表面層蛋白
   3. 蛋白質摺疊
   4. 拉馬錢德蘭圖
   5. 蛋白質摺疊問題
   6. 核糖體上的蛋白質摺疊
   7. 細菌內膜蛋白的組裝
   8. 蛋白質摺疊成新的酶
   9. 纖維蛋白
   10. 未摺疊蛋白反應
   11. 剪接蛋白的訊號控制
   12. 分析和視覺化蛋白質結構的殘基網路
   13. 幫助蛋白質-蛋白質對接的結合位點預測
3. 開發蛋白質結構的新分類
4. 研究蛋白質的技術
   1. 使用熒光顯微鏡計數蛋白質
5. 蛋白質穩態
   1. 合成
      1. 非核糖體肽合成
      2. 細菌蛋白質合成
   2. 純化
      1. 差速離心
      2. 鹽析
      3. 毛細管電泳
      4. 高效液相色譜 (HPLC)
         1. 凝膠過濾色譜
         2. 離子交換色譜
         3. 親和色譜
         4. 疏水相互作用色譜 (HIC)
         5. 柱色譜
         6. 平面色譜
            1. 紙色譜
            2. 薄層色譜
         7. 氣相色譜
         8. 液相色譜
      5. 等電聚焦
      6. 透析
      7. 微型純化
   3. 純化結果分析
      1. 蛋白質鑑定
         1. 醋酸纖維素電泳
      2. 蛋白質定量
         1. 凝膠電泳
         2. SDS-聚丙烯醯胺凝膠電泳埃德曼降解
         3. SDS-聚丙烯醯胺凝膠電泳埃德曼降解
         4. 區域離心
         5. 布拉德福德法
      3. 量子點
      4. 膜蛋白分析
         1. VDAC-1 及其溶液 NMR 分析
   4. 分析超速離心
   5. 交聯技術
   6. 蛋白質序列測定技術
      1. 蛋白質的蛋白水解分析
      2. 質譜
   7. 蛋白質結構測定方法
      1. 核磁共振波譜
      2. 氘代交換質譜
      3. X 射線晶體學
      4. 冷凍電子顯微鏡
      5. 紅外光譜
      6. 中子衍射
      7. 蛋白質結構的連續理論
   8. 使用祖先基因重建分析蛋白質結構和功能
   9. 使用光譜法測量酶活性
   10. 蛋白質糖基化
   11. 脊椎動物和無脊椎動物蛋白水解級聯的比較
   12. 腺苷酸環化酶的構象變化控制訊號轉導的調節
   13. 朊病毒蛋白錯誤摺疊和疾病
   14. 免疫學：蛋白質分析的另一種方法
       1. 抗體和抗原的相互作用
          1. 凝集反應
       2. 抗體在蛋白質研究中的應用
          1. 酶聯免疫吸附測定 (ELISA)
          2. 蛋白質印跡
          3. 熒游標記
          4. 酶聯免疫斑點測定 (ELISpot)
       3. 單克隆抗體的製備
          1. 單克隆抗體生產來源
       4. 多克隆抗體的製備
       5. 動態光散射
   15. 位點預測
   16. 蛋白質錯誤摺疊和人類疾病
6. 蛋白質翻譯
   1. 肉豆蔻醯化
   2. 內部核糖體進入位點
7. 蛋白質修飾
   1. 棕櫚醯化
   2. 異戊烯化
8. 蛋白質翻譯後修飾
   1. 腺苷酸化
   2. ADP-核糖基化
   3. 乙醯化
   4. 組蛋白修飾
      1. 快速訊號和緩慢標記：組蛋白修飾的動態
9. 蛋白激酶介導的蛋白質磷酸化
   1. NMP 激酶
   2. 磷酸酶 PHLPP
   3. 磷脂醯絲氨酸結合基序和 PKC
   4. 磷脂醯肌醇同源結構域富含亮氨酸重複序列蛋白磷酸酶
10. 磷酸化的檢測
11. 蛋白質在訊號轉導中的作用
12. 整合素蛋白
13. 腺苷酸環化酶的構象變化控制訊號轉導的調節
14. 透過 O-連線的 β-N-乙醯氨基葡萄糖 (O-GlcNAc) 進行的蛋白質 O-GlcNAc 修飾
15. 脂質介導的蛋白質乙醯化
    1. 蛋白質被脂肪酸修飾
16. 蛋白質功能
    1. 結構
    2. 結合
       1. 肌紅蛋白
       2. 血紅蛋白
       3. 血藍蛋白
       4. 蛋白質-蛋白質相互作用網路
    3. 催化
       1. 酶分類
       2. 蛋白酶
    4. 切換
17. 監管
    1. 干擾素
    2. HIF
    3. HIF 開關
    4. VHL
18. 溶菌酶
19. Oct 蛋白
20. 拉福拉病
21. 其他不常見的氨基酸
22. 固有無序蛋白
23. 穩定性、突變和可進化性
24. 蛋白質無序
25. 非核糖體肽合成酶 (NRPSs)
26. 克服蛋白質晶體學挑戰
27. 蛋白質進化
28. 沉默資訊調節蛋白
29. 膠原蛋白
30. 絲氨酸蛋白酶抑制劑
31. 糖蛋白
    1. 埃博拉病毒
32. 蛋白質設計
33. 蛋白質設計與藥物遞送
34. 藥物遞送
35. β-螺旋槳蛋白
36. WD40 結構域
37. Bub1 和 BubR1
38. APOBEC3G
39. 谷胱甘肽還原酶
40. TAX1BP1
41. TPD-43

蛋白質功能

1. 結合
   1. 構象選擇
   2. 配體
      1. 金屬結合位點
   3. 結合位點
   4. 鎖和鑰匙
   5. 誘導契合
   6. 過渡態模型
   7. 協同性
2. 跨膜蛋白
   1. α-螺旋膜蛋白
3. 肌紅蛋白
   1. 血紅素基團
      1. 膽紅素
   2. 金屬離子的生物學作用
   3. 肌紅蛋白的氧結合曲線
   4. 其他珠蛋白
4. 血紅蛋白
   1. 血紅蛋白-血紅素基團
   2. 鐮狀細胞性貧血
   3. 地中海貧血
   4. AHSP
   5. 波爾效應
   6. 親和常數
   7. 解離常數
   8. 監管
   9. 2,3-二磷酸甘油酸 (2,3-BPG) 調節
   10. 氧結合曲線
   11. 其他珠蛋白
5. 抗體
   1. 表位
   2. 抗原
   3. 主要組織相容性複合體 (MHC)
      1. I 類 MHC
      2. II 類 MHC
   4. 抗體酶
6. 肌球蛋白
7. 肌動蛋白
8. 胰島素
9. DNA 結合
10. 熒光蛋白
11. G 蛋白
12. LPA 受體
13. G 蛋白機制
14. 鐵蛋白
15. 鐵載體
16. “模糊”相互作用組
17. 蛋白質摺疊和伴侶蛋白
    1. 蛋白質摺疊速率
    2. 熱休克蛋白
18. CCN 蛋白
19. 朊病毒蛋白
20. 細菌蛋白
21. 泛素
22. Cdc48
23. TGFβ 和整合素
24. AB5 毒素
25. PHD 指
26. TATA 結合蛋白
27. 伴侶蛋白
    1. HSP90
28. 功能歸屬
29. 未摺疊蛋白反應
30. TDP-43

膜蛋白

1. 主動運輸
2. 被動運輸
3. 膜梯度和熱力學
4. P 型 ATP 酶
5. ATP 結合盒蛋白
6. 同向轉運蛋白
7. 反向轉運蛋白
8. 單向轉運蛋白
9. 離子通道
   1. 膜片鉗
   2. 瞬時受體電位通道
10. 配體門控離子通道
11. 間隙連線
12. 水通道
13. 核孔複合體
14. 協同轉運蛋白
15. 控制系統：神經系統
16. 膜蛋白的進化
17. 蛋白質功能的組織方案
18. 研究膜蛋白的方法
    1. 溶液核磁共振波譜
    2. 膜中蛋白質的電子晶體學
    3. 冷凍電鏡斷層掃描和 3D 影像平均
19. 膜蛋白組裝成複合物
20. 拓撲
21. G 蛋白偶聯受體
22. 多藥耐藥泵
23. 脂雙層中蛋白質結構的研究：電子晶體學
24. 摺疊
25. 膜曲率
26. 疏水性標度
27. 融合和裂變中的膜蛋白應力
28. 粘膜系統
29. 促胰液素
30. 藥物金剛烷胺與流感病毒 M2 蛋白質質子通道的結合
31. TA 蛋白 (GET) 途徑在年輕男性中的應用

碳水化合物

1. 單糖
   1. 單糖的立體化學
2. 透過高碘酸裂解闡明碳水化合物結構
3. 酮糖
4. 醛糖
5. 二糖
6. 寡糖
7. 使用糖苷酶對寡糖進行測序
8. 多糖
9. /Carbohydrates/Chitin
10. 聚糖
11. 肽聚糖生物合成
12. 糖蛋白
13. 碳水化合物衍生物
14. 碳水化合物和蛋白質
    1. 凝集素
    2. 糖胺聚糖
    3. 蛋白聚糖
    4. 血型
    5. 病毒
       1. HIV 感染背後的機制
15. 碳水化合物代謝
16. 糖原分解

脂類

1. 脂肪酸
   1. 三醯甘油
2. 膽固醇
   1. 膽固醇的生物合成
   2. 脂蛋白
3. 生物膜
4. 膜脂
5. 膜轉運
6. 膜融合
7. 膜裂變
8. 膠束
9. 脂雙層
10. 膜流動性
11. 流動鑲嵌模型
12. 研究膜的技術
    1. 電子顯微鏡
    2. 雙層和囊泡的製備
    3. 掃描量熱法
    4. 熒光光漂白
13. 蠟、肥皂和洗滌劑
    1. 脂肪蠟
    2. 肥皂
    3. 洗滌劑
14. 異戊二烯
15. 脂筏
16. /Lipids/Sample Preparation for Mass Spectrometry-Based Lipidomics Studies
17. 基於質譜的新型脂質結構測定
18. 受體介導的內吞作用
19. 生物合成
    1. 三醯甘油
20. 脂質啟用蛋白激酶
21. 奇數鏈和不飽和脂肪酸的降解
22. 脂質體
23. 脂滴和細胞脂質代謝

核酸

1. 結構
   1. 磷酸酯
   2. 糖
      1. 脫氧核糖
      2. 核糖
   3. 含氮鹼基
      1. 嘌呤
         1. 腺嘌呤
         2. 鳥嘌呤
         3. 嘌呤
         4. 次黃嘌呤
         5. 黃嘌呤
         6. 可可鹼
      2. 嘧啶
         1. 胞嘧啶
         2. 尿嘧啶
         3. 胸腺嘧啶
      3. 核糖核苷酸還原酶
   4. 核苷酸
2. 單體之間的連線
3. DNA
   1. DNA 結構
      1. 端粒
      2. 非典型結構
   2. 超螺旋和核小體
   3. 迴文序列
   4. DNA 變性
   5. 艾弗裡-麥克萊奧德-麥卡錫實驗
   6. 赫希-蔡斯實驗
   7. 查加夫的實驗
   8. 沃森和克里克的文章
   9. 富蘭克林的 DNA X 射線晶體學
   10. 複製過程
       1. DNA 聚合酶
       2. DNA 啟動
   11. 梅塞爾森-斯塔爾實驗
   12. 基因敲除小鼠
   13. 轉基因動物
   14. 轉基因植物
   15. 低色效應
   16. DNA 修復
       1. 錯配修復
       2. DNA 鏈斷裂修復中的多核苷酸激酶/磷酸酶
   17. DNA 包裝
   18. DNA 作為奈米材料
   19. 結構 DNA 奈米技術
   20. 霍利迪連線
   21. 增殖基因和抗增殖基因
   22. 蛋白質-DNA 識別
   23. 介體介導的轉錄調控
   24. 染色質和衰老
   25. 哺乳動物 SIRT6 介導的染色質調控和基因組維持
4. RNA
   1. 信使 RNA (mRNA)
      1. 無義介導的 mRNA 降解
   2. 轉運 RNA (tRNA)
   3. 核糖體 RNA (rRNA)
   4. 小 RNA
      1. 微小 RNA (miRNA)
   5. 其他 RNA
   6. RNA 聚合酶
      1. RNAP 的單分子研究
   7. RNA 依賴性 RNA 聚合酶
   8. RNA 解旋酶
   9. 核糖開關
   10. RNA 摺疊
       1. RNA 的機械展開
   11. 短 RNA
       1. 鹽對機械摺疊的影響
   12. RNA 干擾 (RNAi)
       1. RISC (RNA 誘導的沉默複合體)
   13. DNA 和 RNA 之間的差異
   14. 轉錄
       1. 核酸
       2. 轉錄
       3. 逆轉錄
       4. RNA 聚合酶 II
   15. mRNA 加工和轉運
   16. 翻譯
   17. RNA 修飾
       1. 內含子
       2. 外顯子
       3. RNA 剪接
       4. snRNP
   18. RNA 降解
       1. RNaseT2 功能
       2. 核糖核酸酶
   19. 端粒
   20. RNA 純化
   21. RNA 提取
   22. 短 RNA (sRNA 測序)
   23. 線蟲 RNA
   24. RNA 二級結構
   25. 製作 RISC
   26. 逆轉錄病毒 Gag 蛋白與 RNA 的多種相互作用

1. DNA 操作技術
   1. /Maintaining Genome Integrity
   2. 限制性內切酶
   3. Southern 印跡
   4. Northern 印跡
   5. DNA 測序
   6. DNA 編目
   7. DNA 合成
   8. DNA 擴增
   9. 酒精沉澱
   10. 基因調控
       1. 合成生物學
       2. 鋅指
       3. 代謝物
       4. REM
   11. 細菌轉化技術
2. 遺傳密碼
3. 基因表達
   1. 染色質的守門員：小型代謝物在基因表達中引起巨大變化
4. DNA 突變
   1. 轉座子
   2. 複製數變異
   3. 遺傳性疾病
      1. 泰-薩克斯病
   4. 線粒體疾病
      1. 杜氏肌營養不良症
5. 克隆酶
   1. 用於克隆的酶
      1. T4 DNA 連線酶
      2. T4 RNA 連線酶
      3. T4 多核苷酸激酶
      4. 小腸鹼性磷酸酶
      5. RecA 蛋白
      6. AgarACE^® 酶
   2. 克隆提示
   3. DNA 克隆和載體插入過程
   4. 免疫系統
6. 基因組調控
7. 基因組分析
   1. DNA凝膠電泳
   2. DNA 微陣列
   3. 測序基因組
   4. 單核苷酸多型性 (SNP)
   5. 基因組分析對醫學的影響
   6. 核型分析
8. DNA 重組技術
   1. 噬菌體 λ 的歷史和研究
   2. 質粒
      1. 裂解途徑
      2. 溶源途徑
   3. 基因組文庫
   4. 檢測特定基因
   5. 誘變
   6. 設計基因
   7. 人類基因組計劃
   8. 基因治療
   9. 人工染色體
      1. 細菌人工染色體 (BAC)
      2. 細菌人工染色體 (BAC)
   10. 電穿孔
   11. 293T 細胞

1. 1. 1. 細菌革蘭氏染色
   2. 遺傳和相關實驗
   3. DNA 的定向改變
   4. 真核重組
2. 單分子 DNA 測序
3. 環境中重組 DNA 測定方法
4. 聚合酶鏈式反應
   1. PCR 的執行方式
   2. PCR 的應用
5. 未來的 DNA (DNA 的多種形式)
6. 線粒體 DNA
7. ATP
8. 基因和基因產物的功能歸屬
9. 30nm 染色質纖維

催化

1. 酶
   1. 結合能
   2. 脫溶劑化
   3. 狀態：基態、前穩態和穩態
   4. 輔酶
   5. 輔因子
   6. 輔基
   7. 脫輔基酶和全酶
   8. 活性位點和酶的特異性
   9. 催化三聯體
   10. 酶的進化
   11. 過渡態結合原理
2. 酶原
3. 吉布斯自由能圖
   1. 過渡態
   2. 活化能
   3. 反應中間體
4. 速率和常數
   1. 速率常數
   2. 速率方程
   3. 速率限制步驟
   4. 平衡常數
   5. 初始速率
5. 機制
   1. 酸鹼催化
   2. 共價催化
   3. 金屬離子催化
   4. 近似催化
6. 米氏方程
   1. 米氏常數
   2. K_cat/K_M
   3. 動力學完美
   4. 最大速度
   5. 順序反應
   6. 雙置換反應
   7. 乒乓機制
   8. 變構酶
7. 雙倒數圖
8. 可逆抑制劑
   1. 競爭性抑制劑
   2. 非競爭性抑制劑
   3. 非競爭性抑制劑
9. 不可逆抑制劑
   1. 基團特異性試劑
   2. 親和標籤
   3. 自殺性抑制劑
10. 時間依賴性抑制
11. 過渡態類似物
12. 青黴素
13. pH 對酶活性的影響
14. 定點誘變
15. 多底物反應
16. 催化抗體
17. 溫度對酶活性的影響

特定酶和催化機制

1. 蛋白酶
   1. 水解
   2. 胰凝乳蛋白酶
   3. 半胱氨酸蛋白酶
   4. 天冬氨酸蛋白酶
   5. 絲氨酸蛋白酶
   6. 蘇氨酸蛋白酶
   7. 金屬蛋白酶
   8. 催化三聯體和 S₁ 口袋
   9. AAA+ 蛋白酶
   10. HIV-1 蛋白酶
2. 脫氫酶
3. 苯丙氨酸羥化酶 (PAH)
4. 碳酸酐酶
5. 羧肽酶
6. 激酶
   1. 細胞週期蛋白依賴性激酶
   2. MPS1
7. 細菌核糖體組裝的生物物理研究
8. 限制性內切酶
   1. BamHI
   2. EcoRI
   3. HindIII
   4. XbaI
9. 谷胱甘肽還原酶
10. 核苷酸單磷酸激酶
11. 菲利普斯機制
12. 異構酶
    1. 磷酸三糖異構酶
13. 乒乓機制
14. 乙醯轉移酶
15. 脫乙醯基酶
16. 自由基-SAM 酶
    1. FeMo 輔因子和 FeFe-氫化酶
17. 總結
18. 膜轉運
19. 冷適應酶
20. 膽固醇 24-羥化酶
21. 細胞色素 b6f 複合體
22. 細胞色素 P450 酶
23. 脫氨酶
24. 藥物代謝酶
25. MAO B 酶
26. 環氧合酶
27. PLC 酶
28. 多核苷酸激酶/磷酸酶
29. NLR 感測器
30. GTPase
31. 棕櫚醯轉移酶

酶調節

1. 反饋抑制
2. 同工酶
   1. 酶調節/同工酶分析
   2. 酶調節/酶和代謝物相互作用以及基於 RNA 的基因調控
3. 可逆共價修飾
   1. 磷酸化
   2. 泛素化
      1. 透過多價相互作用實現泛素的多工處理
   3. 甲基化
   4. 乙醯化
   5. 腺苷酸化
   6. 肉豆蔻醯化
   7. 蛋白質賴氨酸乙醯化在代謝中的作用
4. 蛋白水解啟用
5. 酶級聯
6. 轉錄啟用
7. 變構控制
8. 不可逆抑制
9. 氨基酸感應和轉運

激素

1. 睪酮
2. 雌激素
3. 外源激素
   1. 烷基酚
4. 人絨毛膜促性腺激素
5. 資訊素
6. 胃泌素
7. 腎上腺素
8. 人胎盤生乳素

關鍵詞

1. 一般術語
2. 蛋白質術語
3. 有爭議的術語
4. 碳水化合物術語
5. 脂類和細胞膜術語
6. DNA 和 RNA 術語
7. 進化和生物資訊學術語
8. 酶術語
9. 細胞凋亡

有影響力的結構生物化學家

1. 多蘿西·克勞福特·霍奇金
2. 阿爾貝·克勞德
3. 克里斯蒂安·德·迪夫
4. 文卡特拉曼·拉馬克裡希南
5. 羅傑·D·科恩伯格
6. 伊麗莎白·F·諾菲爾德
7. 伊萬·貝爾克斯
8. 詹姆斯·C·王
9. 加藤昌彥
10. 馬蒂亞斯·W·亨特茲
11. 羅莎琳德·富蘭克林
12. 月歧茂
13. 保羅·D·博耶
14. 瑪麗亞·馬納西娜
15. 弗雷德里克·桑格
16. 埃德溫·G·克雷布斯
17. 約翰·C·肯德魯
18. 塞爾曼·A·瓦克斯曼
19. 威廉·H·斯坦
20. 瓦茨拉夫·L·克雷托維奇
21. 萊納斯·鮑林

天然產物

1. 碳-磷鍵

趨性

1. 趨化性

生物化學在醫學中的應用

1. 一氧化碳：一個隱形殺手
2. 由於膜脂異常積累導致的人類遺傳性疾病
3. 多吃水果和蔬菜！維生素 C 如何對抗壞血病
4. X 射線晶體學
5. 靶向腫瘤細胞的抗體

生物化學在動物中的作用

1. 費氏弧菌：讓光明來臨

神經精神疾病中的生化作用

1. 精神分裂症
2. 自閉症
3. 雙相情感障礙
4. 亨廷頓舞蹈症

結構生物化學論文主題

1. RNA 識別基序，一個可塑的 RNA 結合平臺，用於調節轉錄後基因表達
2. 程式性壞死細胞損傷的分子調控
3. 核糖體介導的狂犬病病毒囊泡性口炎病毒的翻譯起始
4. MPS1 蛋白激酶家族

參考文獻

1. The Free Dictionary. Mosby's Medical Dictionary, 8th Edition. © 2009, Elsevier., 2009. Web. 28 Oct. 2012. http://medical-dictionary.thefreedictionary.com/compartment+model.
2. 張亮方. "Controlled Drug Delivery Systems." CENG 207 Lecture 9 “Pharmacokinetics of Drug Dispersion”. University of California, San Diego, La Jolla. 10 May 2012. Lecture.
3. Dhillon, Soraya and Gill, Kiren. "Basic Pharmacokinetics." 28 Oct. 2012. http://www.pharmpress.com/files/docs/clinical_pharmacokinetics_samplechapter.pdf