結構生物化學/WD40 結構域
它們是真核生物基因組中最豐富的結構域蛋白。作為支架,WD40 結構域蛋白參與各種細胞過程,如訊號轉導、細胞分裂、細胞骨架組裝、趨化性和RNA加工。WD 結構域最顯著的特徵是它們介導了蛋白質與另一種蛋白質之間的多種相互作用。

WD40 結構域具有高度對稱的結構,這支援更快速和便捷的摺疊。此外,這些結構域的特點是螺旋槳結構,具有七個葉片。WD40 螺旋槳具有三個獨特的表面,分別是頂部、底部和圓周,它們參與各種相互作用。頂端區域是結構的一部分,其中包含迴圈,這些迴圈連線WD 重複的D 和 A 鏈。
大多數蛋白質-蛋白質和蛋白質-肽相互作用發生在β-螺旋槳中心通道的特定位點。該位點稱為超位點,並且在該位點,大多數相互作用夥伴結合。大多數相互作用發生在螺旋槳的頂面,因為中心通道的核心不可用於相互作用,並且β-螺旋槳的N-或C-末端堆積在中心通道的入口處,因此,大多數相互作用發生在WD40 結構域中。例如,WD40 結構域參與的相互作用之一是球狀蛋白質與包含短肽/線性基序的蛋白質之間的相互作用。
肽-蛋白質相互作用
WD40 和肽之間的相互作用對於動態多蛋白複合物的組裝很重要。當相互作用發生時,許多不同的肽基序結合到螺旋槳的不同位點,但大多數肽結合在β螺旋槳頂部靠近中心通道。結合位點的可變性使WD40 結構域具有理想的平臺,用於組裝不同型別的蛋白質並幫助形成瞬態複合物。

轉導蛋白負責將視紫紅質訊號傳遞到環狀鳥苷一磷酸磷酸二酯酶,它由三個亞基組成:α-、β-和γ-亞基
α-亞基
它包含一個GTP酶結構域。GTP酶結構域與α-螺旋結構域相互作用,α-螺旋結構域不與WD40 結構域相互作用,以及一個N-末端螺旋,它與螺旋槳的側面接觸
β-亞基
它與γ-亞基形成穩定的異二聚體
γ-亞基
它包含兩個螺旋。第一個螺旋與β-亞基螺旋槳之前的N-末端螺旋相連,第二個螺旋與螺旋槳底部的環接觸。γ-亞基控制整個轉導蛋白異三聚體的表達水平,這對於正常的轉導蛋白定位起著重要作用。
- Stirnimann CU, Petsalaki E, Russell RB, Müller CW. "WD40 蛋白推動細胞網路" Trends Biochem Sci. 2010 Oct;35(10):565-74. Epub 2010 年 5 月 5 日。綜述
- Xu C, Min J. "WD40 結構域蛋白的結構和功能。" 結構基因組學聯盟,多倫多大學,101 College St.,多倫多,安大略,加拿大
來源
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:Rhodopsin-transducin.png
http://commons.wikimedia.org/wiki/File:1erj_7bladed_beta_propeller.png