結構生物化學/酶/近似催化
外觀
透過隨機碰撞偶然相遇的底物,與底物反應部分接觸的可能性更小。因此,酶可以採用一種稱為近似催化的策略,透過這種策略,酶將兩種底物聚集在一起,以增加反應速率。這種策略利用了結合能,並使底物處於反應進行的正確方向。通常在反應中,會有平移熵和旋轉熵的損失。在反應中,過渡態比基態更加有序,使得 delta S 為負。該反應發生在酶的活性位點,底物和催化基團將作為一種分子起作用,防止平移和旋轉能量的損失。反應首先從兩種能夠互相找到的分子開始,這使得反應速率取決於反應物的濃度。這是由於分子相互找到的可能性更高。
近似催化的一個例子是,當 NMP 激酶 [[1]] 將兩種核苷酸聚集在一起以促進磷醯基從一種核苷酸轉移到另一種核苷酸。在加入三磷酸腺苷 (ATP) 後,磷酸基團與 NMP 激酶的磷酸基團相鄰。這促進了兩個分子之間磷酸的轉移。