結構生物化學/細胞器/核糖體
核糖體的作用是在tRNA 的幫助下，將信使RNA (mRNA) 翻譯成蛋白質。在真核生物中，核糖體通常存在於細胞的胞質溶膠、內質網或mRNA 以及線粒體的基質中。這些位置合成的蛋白質 在細胞中發揮著不同的作用。在原核生物中，核糖體也存在於胞質溶膠中。這種蛋白質合成器是原核生物和真核生物中唯一存在的細胞器，這表明核糖體是一種早期進化的特徵，很可能存在於真核生物和原核生物的共同祖先中。核糖體不是膜結合的。
核糖體在催化兩個重要而關鍵的生物學過程中也發揮著重要作用。它們負責肽醯轉移，在蛋白質合成過程中形成肽鍵，以及肽醯水解；在這個過程中，核糖體在翻譯完成後從肽醯轉移RNA中釋放完全形成的蛋白質。翻譯是將mRNA（來自轉錄）轉化為功能性蛋白質的過程；涉及的三個步驟是起始、延伸和終止。蛋白質每次翻譯一個氨基酸（三個鹼基對）。在這個過程中，tRNA透過在翻譯過程中將互補鹼基帶到核糖體來幫助核糖體。
由於核糖體合成是真核生物中涉及數百個單獨反應的主要代謝活動，因此在這些過程中最終會發生錯誤。為了處理核糖體合成過程中發生的錯誤，真核生物會降解錯誤的核糖體。此外，不僅會降解錯誤的核糖體，還會降解過量的核糖體。最近的研究表明，真核細胞增強了許多策略來識別特定的功能失調或功能缺陷的核糖體以進行降解[1]。
真核核糖體除了比細菌核糖體具有更復雜的組裝規則外，在翻譯起始時的觸發方式也與細菌核糖體不同。真核核糖體使用掃描機制，至少需要九個起始因子。 [2] 在細菌中，核糖體可以透過在mRNA上找到Shine-Dalgarno序列來識別正確的閱讀框並知道在哪裡附著到mRNA鏈上。這個核糖體結合位點位於mRNA上AUG起始密碼子的上游。在大腸桿菌中，Shine-Dalgarno位點是mRNA上的富含嘌呤的核苷酸序列——5'AGGAGGU 3'，位於起始密碼子上游4到8個鹼基。這個Shine-Dalgarno序列與核糖體30S亞基中的16S rRNA上的序列5'ACCUCCU 3'互補。 [3]
核糖體通常由2個蛋白質亞基和一些rRNA 組成。核糖體的蛋白質 成分首先在胞質溶膠中合成，就像任何其他蛋白質一樣。新合成的蛋白質亞基隨後從細胞核轉運到核仁，即核糖體RNA轉錄的中心。然後使用RNA聚合酶 聚合核糖體合成所需的rRNA。蛋白質合成速率高的細胞具有許多核糖體。
在過去，科學家研究核糖體以更好地瞭解其組成，它由30S、50S、70S和100S組成。所有這些都是由相同的粒子製成，但鎂離子濃度不同。30S和50S是70S的小亞基和大亞基，而100S是70S的集合。真核生物和原核生物的核糖體結構不同。真核生物具有40S（小）和60S（大）亞基，亞基一起形成80S核糖體。 [4] 原核生物具有30S（小）和50S（大）亞基。這些亞基在翻譯過程中協同工作以合成蛋白質。
在原核生物中，小亞基（30S）和大亞基（50S）一起構成70S核糖體。30S亞基由21個核糖體蛋白和16S rRNA組成。它的功能是解碼和破譯mRNA，以確定對應於密碼子中三個鹼基的氨基酸。小亞基由主體（5'）、平臺區域（中央結構域）和頭部（3'）組成。每個元件可以彼此獨立地形成。小亞基還包含一個3'次級結構域，包括最後兩個螺旋（44和45）以及rRNA的3'端的末端。小亞基的結構成分已被證明在結構上彼此獨立，表明在蛋白質合成過程中，它們相對於彼此移動和構象變化。長44螺旋從主體延伸到頭部，跨越整個小亞基，充當資訊在整個亞基中傳遞的潛在中繼。與小亞基不同，大亞基大多是剛性的，其流動性僅限於其外圍區域。50S亞基由33個蛋白質和23S和5S rRNA組成。
mRNA結合位點位於小亞基的頸部，而大亞基包含肽醯轉移中心（PTC），氨醯和肽醯-tRNA附著在該中心。三個結合位點是A、P和E。結合位點A吸引氨醯-tRNA，結合位點P吸引肽醯-tRNA，結合位點E（出口位點）吸引脫醯tRNA。反密碼子莖環連線到小亞基的mRNA結合位點上的互補密碼子，而tRNA的氨基酸端連線到位於PTC中的A和P位點。GTP酶相關中心和沙星/蓖麻毒蛋白環位於大亞基，有助於刺激蛋白質延伸所需的GTP水解。
核糖體組裝包括轉錄、翻譯、rRNA和核糖體蛋白的摺疊、核糖體蛋白的結合以及組裝成分的結合和釋放，以形成核糖體。核糖體組裝中有兩個中間體，體外和體內。一種體外組裝30S的方法是僅使用遊離的rRNA和核糖體蛋白。另一種方法是將16S rRNA與純化的重組蛋白和前體16S rRNA結合。由於組裝蛋白質的不同方法，核糖體組裝也隨不同溫度而變化。在0°C -15°C的低溫下，由16S rRNA和15個核糖體蛋白組成的重組中間體（RI）粒子形成並沉降到21S-22S。然後，RI粒子在加熱到40°C後重新排列，並沉降到25S-26S。完成這兩個過程後，RI粒子與剩餘的蛋白質一起可以形成30S亞基。
相比之下，50S亞基的體外組裝需要比30S組裝機制更多的步驟和更苛刻的條件。有三個重組中間體，每個中間體都依賴於不同的溫度和離子條件。第一個中間體RI50（1）產生33S粒子。當RI50（1）被加熱時，RI50（2）形成並沉降在41S-43S處。剩餘的蛋白質形成RI50（3），它產生非活性的48S粒子。為了使48S粒子成為活性的50S亞基，需要提高溫度和鎂離子濃度，以及5S rRNA的參與。
與體外組裝機制類似，30S亞基的體內組裝有兩個中間體（p130S和p230S），而50S亞基有三個中間體（p150S、p250S和p350S）。但是，重組中間體與體外不同。30S亞基的中間體產生21S和30S粒子，而50S亞基的中間體產生32S、43S和50S粒子。體內組裝中的中間體是前體rRNA，它與使用成熟rRNA的體外不同。為了完成核糖體組裝機制，這些前體rRNA在多聚核糖體中發生轉化。
真核生物核糖體由 40S 和 60S 亞基組成，它們都有一個溶劑暴露側和一個亞基介面。與亞基介面相比，溶劑暴露側包含更高濃度的真核生物特異的蛋白質和 RNA 元素。
真核生物特異蛋白負責透過三級接觸穩定 40S 結構。大多數真核生物特異蛋白和延伸部分用於連線 40S 和 60S 亞基中的其他蛋白質。40S 亞基有 14 個這種相互連線的蛋白質位於頭部。真核生物特異蛋白和延伸部分在 60S 亞基中起著更大的作用，因為它們的蛋白質介導的連線更廣泛，並延伸到整個亞基。60S 特異性延伸部分由 β 摺疊和長的 α 螺旋組成，它們在長距離三級相互作用中至關重要，這意味著它們能夠跨越亞基進行相互作用。這種特徵是真核生物特有的，因為蛋白質-蛋白質接觸在原核生物核糖體中非常罕見。
40S 和 60S 亞基透過真核生物特異的亞基間橋連線，從而形成 80S。這是透過真核生物特異性橋樑在 40S 上形成，RPL19 與 ES6E 相互作用，而 RPL24 與 rpS6 相互作用。另外兩個真核生物特異性橋樑透過 60S 段 ES31 連線到 rpSA，另一個 60S 段 ES41 連線到來自 40S 亞基的 rp58。[5]
核糖體輔助因子有助於促進體外錯誤摺疊。體外錯誤摺疊是導致體外速度遠低於體內的原因。核糖體因子可用作“檢查點”，以確保組裝正確。核糖體輔助因子的例子包括 DEAD-box 蛋白、伴侶蛋白和 GTP 酶。DEAD-box 蛋白是幫助 RNA 正確摺疊的因子。DEAD-box 蛋白的過表達可以抑制另一種菌株的缺失。DEAD-box 蛋白 (DBP) 的特徵在於大約 350 個氨基酸的核心，每個核心至少包含 9 個保守的氨基酸基序。研究表明，這些蛋白質利用來自 ATP 水解的能量來重新排列分子間或分子內 RNA 結構，或解離 RNA-蛋白質相互作用。在真核生物中，DEAD-box 蛋白在核糖體生命週期中至關重要，但在 E. coli 中，它們通常是不必要的。迄今為止，在 E. coli 中已鑑定出五個編碼 DEAD-box 蛋白的不同基因 - SrmB、CsdA、DbpA、RhlE 和 RhIB - 它們是用途廣泛的輔助因子，由於它們在蛋白質生物合成和核糖體組裝中的作用，有助於進一步瞭解許多細胞中的細胞過程。例如，CsdA 和 SrmB 對正常的細胞生長至關重要；缺乏這些蛋白質的細胞表現出嚴重的核糖體效應。
核糖體在我們進化中發揮了重要作用。據說核糖體的起源植根於 RNA 世界，早於蛋白質的存在。核糖體在結構和功能上隨著複雜且多功能的肽的形成而進化。當 Venkatraman Ramakrishnan 和他的團隊確定了核糖體的晶體結構，並以原子細節描述了它時，核糖體科學研究取得了重大突破。揭示核糖體的結構使科學家能夠更仔細地觀察與核糖體功能相關的機制。更具體地說，例如，根據 Rodnina 和 Wintermeyer 在“趨勢生化科學”雜誌上發表的“核糖體獲得諾貝爾獎”一文，對核糖體結構的瞭解揭示了翻譯過程的細節，例如“核糖體如何透過在解碼位點建立特定接觸來檢查正確的密碼子-反密碼子相互作用”。最近，核糖體被證明作為抗生素產品的靶點具有巨大的臨床潛力。隨著抗生素的過度使用和抗生素耐藥性的不斷上升，核糖體可能是對抗臭名昭著的抗生素耐藥性的新型抗菌劑的基礎。
在胞質溶膠中發現的不與任何其他細胞器結合的核糖體被稱為遊離核糖體。已知這些核糖體產生非疏水性蛋白質，最終在胞質溶膠中發揮作用。一個例子是糖分解第一步的催化劑。
附著在內質網或ERare上的核糖體被稱為 ER 核糖體。這些核糖體使粗糙內質網呈現出“粗糙”的外觀。由粗糙內質網核糖體產生的蛋白質被髮送到內質網腔，在內質網中進行修飾，然後在囊泡中被運送到高爾基體的順面，蛋白質在那裡進行進一步修飾。
酶透過活性位點殘基轉化其底物。這種轉化可以允許直接參與化學催化，例如促進質子轉移反應和共價化學反應。這些活性位點殘基可以形成共價鍵，充當一般的酸鹼或親核試劑。核糖體經歷一般的酸鹼或親核催化。殘基也可以作為過渡態 (TS) 的結構補充，溶解或重組水分子，並透過利用結合能降低 ΔS（熵）。在延伸過程中，核糖體 PTC 催化酯鍵的氨解：A 位點氨醯 tRNA 的 α 氨基充當親核試劑，攻擊 P 位點肽醯 tRNA 上連線 tRNA 和肽的酯鍵的羰基碳。為了有效地形成肽鍵，胺與酯反應。在核糖體的幫助下，這種反應很快，因為它使反應速度提高了大約 106-107 倍。在肽鍵形成之前，氨醯 tRNA 以 10 s-1 的速度連線到 A 位點，這比形成肽鍵的三元複合物的速度要慢得多。緩慢的反應速度允許最小限度地使用底物類似物，即類似於 tRNA CCA 3’ 端或 α 胺被羥基取代的短 RNA 片段。最小的底物包括嘌呤黴素 (Pmn)、C-嘌呤黴素 (C-Pmn) 和 CC-嘌呤黴素 (CC-Pmn)。這些底物快速結合到核糖體，與 P 位點底物反應，以允許對其化學關係進行直接分析。最近，使用動力學、生化、遺傳和計算的方法分析，使核糖體晶體學取得了更大的進展。然而，關於質子轉移機制仍然存在許多問題。核糖體催化的肽醯轉移伴隨著活化熵的降低，這提供了對核糖體催化涉及定義降低活化熵的分子機制的更多理解，同時考慮了底物、活性位點的位置、脫溶劑化和靜電遮蔽。
1)肽醯轉移 2)肽釋放 3)用於研究核糖體的過渡態類似物的結構
當細胞處於壓力、疾病狀態和正常狀態時，RNA 損傷會發生。暴露於紫外光、氧化、氯化、硝化和烷基化會導致核鹼基發生化學修飾，從而產生觸發核糖體降解途徑的可能性。
核糖體合成中存在幾種錯誤來源，例如 rRNA 序列的改變（順式發生）和組裝因子或核糖體蛋白的結合失敗或丟失（反式發生）。除了這些主要來源外，特定的生長條件也會對核糖體合成產生一定的影響。例如，飢餓需要過量的核糖體，這些核糖體被有效地週轉[6]。
mRNA 解碼和肽醯轉移反應是核糖體翻譯中兩個具有專門功能的亞基[7]。每個真核生物核糖體由 4 個 rRNA 和約 80 個核糖體蛋白組成。合成、成熟、運輸單個核糖體並組裝成核糖體亞基的過程需要約 200 個蛋白質反式作用輔助因子和大量的小核仁 RNA (snoRNA) 的參與。這些過程參與了數百個可能導致錯誤的獨立反應[8][9]。此外，許多核糖體蛋白還執行非核糖體功能，因此這些過程中與核糖體生物合成無關的功能目前被歸類為核糖體合成因子 (RSFs)。RSFs 包括與細胞週期程序、前 mRNA 剪接、DNA 損傷反應、核組織和端粒維持的聯絡。由於核糖體組裝途徑中發生的反應數量眾多，發生錯誤的可能性非常高，例如對細胞活力和人類健康的潛在危害。例如，無法正確結合或丟失合成因子會導致錯誤核糖體的產生，例如缺少部分核糖體蛋白或攜帶錯誤摺疊的 rRNA，這將影響翻譯。因此，細胞會發展出控制機制來避免此類問題。例如，參與晚期細胞質核糖體組裝步驟的合成因子可以在早期階段先與前 rRNA 結合，將前核糖體帶入有效的合成途徑[10]。
順式突變：非功能性核糖體 RNA 降解
[edit | edit source]已知許多途徑可以控制成熟 RNA 分子的結構完整性[11]。控制 mRNA 降解的途徑之一是“無通途”降解 (NGD)，它會導致特定核糖體的降解[12]。LaRivie`re 等人介紹了一種方法來測試功能性和非功能性核糖體位點的突變是否會影響 rRNA 穩定性，即在細菌中對解碼位點和肽醯轉移酶中心的必需核糖體功能位置進行替換。該實驗的結果是識別出非功能性 rRNA 降解，一種檢測和消除成熟核糖體中功能失調部分的途徑[13]。
反式突變：TRAMP-外泌體途徑和核仁監控
[edit | edit source]發現異常的核仁和核前 rRNA 被一種核監控機制積極降解，該機制涉及在有缺陷的前 rRNA 的 3'-端新增非結構化的寡聚腺苷酸尾巴。這是透過 TRAMP 複合物的聚合酶活性完成的，之後由 RNA 外泌體降解。TRAMP 複合物由一個多聚 (A) 聚合酶、一個含有鋅指的推定 RNA 結合蛋白和 DEVH 解旋酶 Mtr4 組成。該途徑從新增短的多聚 (A) 尾巴開始，以及 TRAMP 複合物與 RNA 的實際結合，這兩種作用使偏離的分子降解。這是透過將它們與正常 RNA 分開，並激發外泌體活性來實現的[14]。
透過核糖體自噬和 PMN 降解大量核糖體和前核糖體
[edit | edit source]抑制生長的條件會導致核糖體合成停止。從簡單的分子（如氨基酸和糖）合成複雜分子被阻礙，現有的前核糖體和成熟核糖體被引導到大量的降解途徑。為了應對壓力，並適應新的環境，前核糖體和成熟核糖體被傳遞到回收，用於重要的細胞成分。泛素是一種小的調節蛋白，對於 25S NRD（非功能性 rRNA 降解）至關重要，它也負責大量核糖體的降解[15]。
自噬是一種分解代謝機制，它將不需要或功能失調的細胞成分帶到溶酶體（或酵母和植物中的液泡）中進行細胞降解[16]。飢餓條件會導致大量細胞質（連同蛋白質）以及整個細胞器（如核糖體和線粒體）組裝，並透過兩種主要型別的自噬迴圈利用：微自噬和巨自噬。巨自噬涉及在細胞器周圍形成雙層膜，這種結構被稱為自噬體[17]。這隔離了細胞器，並將其傳遞到溶酶體，溶酶體透過內吞作用吞噬該細胞器，以便分解和迴圈利用[18]。相反，在微自噬過程中，溶酶體透過溶酶體膜的內折直接吞噬細胞質物質[19]。由於溶酶體和液泡含有非特異性水解酶，因此自噬基本上可以降解任何生物分子。巨自噬和微自噬對細胞在飢餓期間的存活至關重要。這兩種機制都與常見的反式作用因子相關聯，並且本質上都是大量的降解過程。然而，研究表明，這兩種通道中都存在選擇性型別[20]。
核糖體自噬是酵母中的一種過程，其中大小核糖體亞基透過選擇性巨自噬被傳遞到液泡中。該過程是由長時間的氮飢餓引起的，並且只針對核糖體亞基[21]。大小核糖體亞基的核糖體自噬依賴於不同和獨立的途徑。大亞基的週轉動力學增加依賴於 Ubp3 泛素蛋白酶及其啟用因子 Bre5。當 UBE3 或 BRE5 發生突變時，小亞基的週轉速率增加受到的影響微乎其微，這表明核糖體自噬存在獨立的途徑。然而，對於小核糖體亞基的核糖體自噬，其效應器仍然未知[22]。由於 Upb3 去泛素化對於 60S 核糖體自噬是必要的，因此缺乏 Upb3 的細胞中許多核糖體相關蛋白的泛素化水平會升高，而這些蛋白尚未被鑑定。人們認為，Upb3-Bre5 目標的去泛素化有助於自噬體的核糖體包裝，或允許自噬體成熟和/或與液泡融合[23]。
核糖體監控對人類健康的影響
[edit | edit source]RNA 的改變會導致核糖體降解，其中一些會導致嚴重的疾病。RNA 損傷不僅是壓力和疾病狀況的結果，而且在正常細胞生長過程中也會發生。暴露於紫外線、氯化、氧化、烷基化和硝化都會導致 RNA 和 RNP 中的核鹼基發生化學修飾，以及 RNA-RNA 和 RNA-蛋白質交聯。[24] 許多人認為 RNA 氧化可能與疾病進展有關，並且許多因素，包括與蛋白質或鐵的結合程度，可能是導致 RNA 易受氧化損傷的原因。一些由紫外線輻射和氧化引起的核糖體 RNA 損傷案例已導致人類神經退行性疾病，如阿爾茨海默病、帕金森病和動脈粥樣硬化斑塊。[25] 活性氧 (ROS) 是由時間性衰老、氧化應激和其他凋亡刺激產生的。暴露於高水平 ROS 的酵母細胞會大量片段化成熟的 5.8S 和 25S rRNA。[26] 給予抗代謝物和化療藥物 5-氟尿嘧啶 (5-FU) 的酵母細胞會積累聚腺苷酸化前 rRNA。在對藥物高度敏感的胞外體複合物中，這些積累會受到損害，表明核仁監視是導致 5-FU 降解的原因。許多核仁壓力，例如基於藥物的前 RNA 加工和 rRNA 合成干擾，會導致核仁分解、p53 穩定和細胞週期進展缺陷和/或凋亡。[27]
核糖體功能特化
[edit | edit source]在每個核糖體的核心，也就是蛋白質工廠，存在著核糖體蛋白。最近的研究表明，這些核心蛋白在不同的生長條件下核糖體之間可能存在差異，而這些差異賦予了更有效地翻譯特定 mRNA 亞群的能力。核糖體存在於每個活生物體中，用於相同的目的：從 mRNA 合成蛋白質。以前，人們認為核糖體是均質的，沒有任何結構多樣性。由於功能遵循結構，因此這些差異應該會改變給定核糖體對更多互補 mRNA 鏈的親和力。除了核心變體之外，核糖體 RNA 的轉錄後修飾會導致額外的結構差異，因此會導致功能特化。為了使核糖體具有功能特化，需要生產細胞對不斷變化的環境條件敏感，從而使正在合成的核糖體表現出影響翻譯的生化差異。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3056915/
參考文獻
[edit | edit source]Edward Ki Yun Leung, Nikolai Suslov, Nicole Tuttle, Raghuvir Sengupta 和 Joseph Anthony Piccirilli。“核糖體介導的肽基轉移催化機制”。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21548786
Sebastian Klinge, Felix Voigts-Hoffmann, Marc Leibundgut 和 Nenad Ban。“真核核糖體的原子結構”。Zahra Shajani, Michael T. Sykes 和 James R. Williamson。“細菌核糖體的組裝”。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21529161
Gilbert WV。“核糖體的功能特化？”趨勢生化科學。2011 年 3 月；36（3）：127-32。Epub 2011 年 1 月 16 日。PMID：21242088 [PubMed - 索引用於 MEDLINE] http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3056915/
- ↑ Lafontaine, Denis。“Elsevier：文章定位器”。ScienceDirect.com | 搜尋超過 1000 萬篇科學、健康、醫學期刊全文文章和書籍。無處，無日期。網路。2012 年 11 月 20 日。<http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S096800040900245X>。
- ↑ Sebastian Klinge, Felix Voigts-Hoffmann, Marc Leibundgut 和 Nenad Ban。“真核核糖體的原子結構”。
- ↑ Joan L. Slonczewski, John W. Foster。“微生物學：不斷發展的科學”。
- ↑ Sebastian Klinge, Felix Voigts-Hoffmann, Marc Leibundgut 和 Nenad Ban。“真核核糖體的原子結構”。
- ↑ Sebastian Klinge, Felix Voigts-Hoffmann, Marc Leibundgut 和 Nenad Ban。“真核核糖體的原子結構”。
- ↑ Lafontaine, Denis。“Elsevier：文章定位器”。ScienceDirect.com | 搜尋超過 1000 萬篇科學、健康、醫學期刊全文文章和書籍。無處，無日期。網路。2012 年 11 月 20 日。<http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S096800040900245X>。
- ↑ Steitz, T.A. (2008) 對動態核糖體機器的結構理解。Nat. Rev. Mol. Cell Biol. 9, 242–253
- ↑ Henras, A.K. 等人。(2008) 真核核糖體生物合成的轉錄後步驟。細胞。分子。生活科學。65, 2334–2359
- ↑ Strunk, B.S. 和 Karbstein, K. (2009) 推動核糖體組裝。RNA 15, 2083–2104
- ↑ Lafontaine, D. 等人。(1995) 18S rRNA 二甲基化酶 Dim1p 是酵母前核糖體 RNA 加工所必需的。基因開發。9, 2470–2481
- ↑ Doma, M.K. 和 Parker, R. (2007) 真核生物的 RNA 質量控制。細胞 131, 660–668
- ↑ Doma, M.K. 和 Parker, R. (2006) 翻譯延伸停滯的真核 mRNA 的內切核酸酶裂解。自然 440, 561–564
- ↑ LaRiviere, F.J. 等人。(2006) 成熟真核 rRNA 的後期作用質量控制過程。分子。細胞 24, 619–626
- ↑ Lafontaine, Denis。“Elsevier：文章定位器”。ScienceDirect.com | 搜尋超過 1000 萬篇科學、健康、醫學期刊全文文章和書籍。無處，無日期。網路。2012 年 11 月 20 日。
- ↑ Lafontaine, Denis L.J。“核糖體的‘垃圾桶’：真核生物如何降解它們的核糖體。”趨勢生化科學 35.5 (2010): 267-77。
- ↑ Lin NY, Beyer C, Gießl A 等人。(2012 年 9 月)“自噬調節 TNFα 介導的實驗性關節炎中的關節破壞”。Ann. Rheum. Dis. doi:10.1136/annrheumdis-2012-201671。PMID 22975756
- ↑ Česen MH, Pegan K, Spes A, Turk B (2012 年 7 月)“溶酶體途徑導致細胞死亡及其治療應用”。Exp. Cell Res. 318 (11): 1245–51。doi:10.1016/j.yexcr.2012.03.005。PMID 22465226。
- ↑ Mizushima N, Ohsumi Y, Yoshimori T (2002 年 12 月)“哺乳動物細胞的自噬體形成”。細胞結構。功能。27 (6): 421–9。PMID 12576635。
- ↑ Česen MH, Pegan K, Spes A, Turk B (2012 年 7 月)“溶酶體途徑導致細胞死亡及其治療應用”。Exp. Cell Res. 318 (11): 1245–51。doi:10.1016/j.yexcr.2012.03.005。PMID 22465226。
- ↑ Lafontaine, Denis L.J。“核糖體的‘垃圾桶’：真核生物如何降解它們的核糖體。”趨勢生化科學 35.5 (2010): 267-77。
- ↑ Kraft, Claudine, Anna Deplazes, Marc Sohrmann 和 Matthias Peter。“成熟的核糖體在飢餓時透過自噬途徑選擇性降解，該途徑需要 Ubp3p/Bre5p 泛素蛋白酶。”自然細胞生物學 10.5 (2008): 602-10。
- ↑ Lafontaine, Denis L.J。“核糖體的‘垃圾桶’：真核生物如何降解它們的核糖體。”趨勢生化科學 35.5 (2010): 267-77。
- ↑ Kraft, Claudine, Anna Deplazes, Marc Sohrmann 和 Matthias Peter。“成熟的核糖體在飢餓時透過自噬途徑選擇性降解，該途徑需要 Ubp3p/Bre5p 泛素蛋白酶。”自然細胞生物學 10.5 (2008): 602-10。
- ↑ Wurtmann, Elisabeth J. 和 Sandra L. Wolin。“RNA 受到攻擊：細胞處理 RNA 損傷。”生物化學和分子生物學批判性評論 44.1 (2009): 34-49。
- ↑ Nunomura, Akihiko, Tim Hofer, Paula I. Moreira, Rudy J. Castellani, Mark A. Smith 和 George Perry。“阿爾茨海默病和相關神經退行性疾病中的 RNA 氧化。”Acta Neuropathologica 118.1 (2009): 151-66。
- ↑ Mroczek, S. 和 J. Kufel。“凋亡訊號誘導酵母中核糖體 RNA 的特異性降解。”核酸研究 36.9 (2008): 2874-888。
- ↑ Lafontaine, Denis L.J。“核糖體的‘垃圾桶’：真核生物如何降解它們的核糖體。”趨勢生化科學 35.5 (2010): 267-77。