結構生物化學/有機化學/生物化學重要有機反應
生物化學與有機化學有著密切的關係，因為體內相當一部分反應是透過有機反應發生的。因此，從有機化學的角度來看一些重要的生物化學分子及其周圍的反應非常重要。透過形成肽鍵，形成了長的多肽鏈，這些鏈可以摺疊成蛋白質。
磷酸二酯鍵是透過酯化反應在兩個戊糖和一個磷酸基團之間形成的鍵。它是透過強共價鍵形成的，其中連線在一起的磷酸基團帶負電荷，因此它們排斥親核物種，例如氫氧根離子。這使得磷酸二酯鍵能夠抵抗水解攻擊，與大多數其他酯不同。這些鍵是所有生命的重要組成部分，構成核酸（包括DNA 和RNA）的主鏈。磷酸二酯鍵透過將 DNA 鏈的 3’ 端與另一條鏈的 5’ 端連線在一起，將糖的 3’ 端的羥基與另一條糖的 5’ 端的羥基連線起來。由於糖基中的遊離 2’ 羥基，兩個核糖核苷酸之間的磷酸二酯鍵可以透過鹼性水解過程斷裂。
磷酸二酯酶是催化磷酸二酯鍵水解並修復 DNA 序列的酶。
DNA 聚合酶 是幫助催化磷酸二酯鍵形成的酶，透過以下反應
(DNA)n + dNTP <=> (DNA)n+1 + PPi
在這個公式中，dNTP 是脫氧核苷酸，PPi 是焦磷酸根離子。
1. Berg, Jeremy M. (2007). Biochemistry, 6th Ed., Sara Tenney. ISBN0-7167-8724-5.