結構生物化學/RNA的機械展開
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RNA的機械展開已成為研究RNA摺疊問題的首選方法,因為它不需要高溫或變性劑。雷射鑷子的發明使得這項技術更加有價值,因為它可以對單個RNA分子施加力,並清晰地觀察其展開和重新摺疊。為了發現RNA的結構轉變,會施加測量的力並測量鏈的端到端距離;這也允許計算所做的機械功。此外還開發了FRET技術,即熒光共振能量轉移,用於闡明RNA摺疊構象變化動力學(Li,Vieregg,Tinoco Jr.,78)。
在研究金屬離子鍵合時,機械展開是首選研究方法,原因有幾個。光鑷的使用允許在生理條件下研究RNA,並且鑷子施加的力隻影響非共價相互作用。因此,熱力學計算和解釋保持簡單;施加的力隻影響RNA的結構,而不影響水分子和離子的活性(85)。因此,科學家在實驗中不需要考慮依數性質。此外,可以操縱RNA構象,使科學家可以測量RNA中相互作用的形成或斷裂。總的來說,這種方法的開發使研究RNA結構變得更加容易、更準確。
Li,Pan T.X.,Jeffrey Vieregg 和 Ignacio Tinoco。 “RNA 如何展開和重新摺疊。”《生物化學年度評論》 77.1 (2008):77-100。印刷版。