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結構生物化學/酶催化機制/脫氫酶

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脫氫酶

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脫氫酶催化醇類氧化為羰基化合物,使用 NAD+ 或 NADP+。一些脫氫酶對一種輔酶具有特異性。此反應可被 NADH 或 NADPH 還原。在醇的氧化中,脫氫酶中的一種轉移到 NAD+ 的煙醯胺環的 4 位,透過去除兩個氫原子。因此,羰基是由該反應產生的。此反應具有立體專一性。該酶可以攻擊環的任一側,導致不同的構象和特性。具有 syn 構象的酶將更快地催化羰基的還原反應。具有 anti 構象的酶比前一種酶反應性更低。存在不同型別的脫氫酶,其中一些簡要介紹如下。

1. 醇脫氫酶

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醇脫氫酶催化醇類與醛類和酮類反應,使用 NAD+ 作為輔酶。它還在酶底部具有鋅離子位點。在催化過程中,鋅離子與 NAD+ 結合。在機制上,輔酶透過氧化酶中的醇與酶結合。酶-NADH 複合物的解離是速率決定步驟。

2. L-乳酸脫氫酶

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L-乳酸脫氫酶透過使用 NAD+ 作為輔酶,氧化 L-乳酸與丙酮酸的可逆反應。醇基變為酶的羰基。L-乳酸或丙酮酸透過輔酶與酶結合。因此,輔酶總是先與酶結合。其他底物也可能與酶結合。乳酸脫氫酶在糖酵解中起著至關重要的作用。為了使糖酵解發生,必須有 NAD+ 可用。在厭氧條件下,沒有足夠的 NAD+ 可用於糖酵解,因為所有 NAD+ 都被困在 NADH 形式(氧氣不足意味著沒有氧氣存在於電子傳遞鏈的末端接收電子)。乳酸脫氫酶透過幫助將 NADH 轉換為 NAD+ 來促進糖酵解的發生。乳酸脫氫酶透過將丙酮酸轉換為乳酸來做到這一點。下圖解釋了此反應。

   O  O                OH  O                               
   ‖  ‖                |   ‖                                

H3C – C – CO- + NADH ↔ H3C – CH – CO- + NAD+

Pyruvate             Lactate
                         

如所示,兩個電子從 NADH 中去除,並且新增一個質子以形成乳酸,並將 NADH 氧化為 NAD+

3. 蘋果酸脫氫酶

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蘋果酸脫氫酶透過可逆反應將蘋果酸氧化為草醯乙酸。NADH 和 NAD+ 以相同的親和力結合。換句話說,它透過 NAD+ 或 NADP 催化蘋果酸脫氫為草醯乙酸,或催化蘋果酸脫羧為丙酮酸。

4. 穀氨酸脫氫酶

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穀氨酸脫氫酶透過氧化脫氨作用催化穀氨酸中氮原子轉化為銨離子(見下圖反應方案)。在氧化脫氨作用中,反應首先透過碳-氮鍵的脫氫開始,然後導致稱為席夫鹼中間體的亞胺中間體。第一步利用穀氨酸脫氫酶 (GDH) 並利用輔酶 NAD+,輔酶 NAD+ 被還原為 NADH [1]。接下來,席夫鹼的水解導致 α-酮戊二酸和遊離銨離子。由於銨離子的快速去除,反應在正方向進行。穀氨酸脫氫酶位於細胞的線粒體中。穀氨酸脫氫酶是獨一無二的,因為它在某些生物體中能夠在其催化反應中使用 NAD+ 或 NADP+。這種能力是獨一無二的,因為 NADPH 用作生物合成反應中的還原劑,而 NAD+ 通常用作大多數分解代謝反應中的氧化劑,而谷氨醯胺脫氫酶不特定於兩者。

FINAL GLUTAMATE

參考文獻

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Alan Fersht,酶結構與機制。

Jeremy M. Berg,John L. Tymoczko,Lubert Stryer。生物化學(第 6 版)。紐約。W.H. Freeman and Company,2007,2002。

Aaron Coleman,Meredith Gould,Jose Luis Stephano。生化技術。Hayden-McNeil Publishing,2013。

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