結構生物化學/蛋白質/腺苷化
外觀
腺苷化,也稱為腺苷醯化或AMPylation,是指透過共價鍵將AMP分子連線到蛋白質側鏈的過程。它有兩個主要功能:1)透過翻譯後修飾調節酶活性;2)產生蛋白質、肽或氨基酸的不穩定中間體,以允許熱力學上不利的反應發生。
腺苷化在涉及RNA腺苷化時具有特定的應用。有一種已知的程式允許使用T4 DNA連線酶進行RNA 5'腺苷化。基本上,這是一種使RNA腺苷化的方法,使其成為5',5'-腺苷焦磷酸帽結構。這種新的腺苷化RNA結構是理想的,因為它可以研究需要這種中間體的某些自然生化途徑。5'腺苷化RNA在某些體外選擇程式中也很有用,以鑑定特異性使用5'腺苷化RNA作為反應性RNA底物的核酸酶。鑑於腺苷化RNA被認為是過渡態分子,在酶底物複合物方面已發展成為最有利的狀態,這一點尤其有利。換句話說,5'RNA的腺苷化由於其作為過渡態底物的性質,對於想要觀察的生化途徑來說,可以形成更好的酶底物複合物。除了作為選擇性催化反應的RNA底物外,它還應用於RNA'5加帽和5'標記。在“T4 DNa連線酶有效地進行RNA5'腺苷化以促進實際應用”一文中表明,使用蛋白質酶T4 RNA連線酶以及一些DNA寡核苷酸,可以將AMP基團淨轉移到所需RNA底物的單磷酸酯末端。
如圖所示,小分子或氨基酸的羧基可以被腺苷化形成不穩定中間體。
幾十年來,谷氨醯胺合成酶的例子一直被用來解釋腺苷化的原理,但最近在Rho和Rab GTPase腺苷化方面的發現顯示出在揭示腺苷化其他方面的潛力。
- Itzen A,Blankenfeldt W,Goody RS。腺苷醯化:被遺忘的翻譯後修飾的復興。趨勢生物化學科學。2011年4月;36(4):221-8。Epub 2011年1月20日。
T4 DNA連線酶有效地進行RNA 5'-腺苷化以促進實際應用,楊明,Scott K. Silverman