結構生物化學/酶催化機制/總結
酶使用以下方式加速反應
接近效應和取向效應
靜電催化
過渡態優先結合
誘導契合
通用酸鹼催化
共價催化
金屬離子催化
酶透過降低活化能 DG‡ 來加速化學反應。
過渡態的強結合和底物的弱結合導致最大速率，因為所有結合能都用於降低 DG‡。
任何將部分結合能用於其他目的的過程，例如蛋白質構象變化，都會降低最大速率。
在生理條件下，最大速率是透過最大化 kcat/Km 以及 Km 大於生理 [S] 來實現的。這意味著大多數酶將是自由的，可以與底物分子相互作用，並且每次相遇都會導致反應。
http://www.bmb.psu.edu/courses/bmb401_spring2004/lecture_notes/lecture11_2004.pdf