生物資訊學

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目錄

• 前言
• 介紹

• 第一部分：分子生物學
  1. 分子生物學的中心法則
  2. DNA 結構
  3. RNA 結構
  4. 蛋白質 & 核酸
  5. 人類基因組

• 第二部分：序列搜尋和比對
  1. 序列資料庫
  2. 核酸搜尋演算法
  3. 核酸比對演算法
  4. 蛋白質比對演算法

• 第三部分：系統發育
  1. 理解系統發育樹
  2. 距離演算法
  3. 簡約演算法
  4. 似然演算法
  5. 貝葉斯演算法

• 第四部分：基因組學
  1. 全基因組組裝
• 第五部分：基因表達
• 第六部分：蛋白質結構
  • • 蛋白質摺疊
    • 蛋白質結構預測
      • 二級結構預測
      • 同源建模
      • 從頭結構預測
      • 接觸預測
    • CASP
• 第七部分：蛋白質組學
• 第八部分：代謝組學
• 第九部分：宏基因組學

• 第十部分：生物序列和生物多樣性
  1. 序列多樣性導致的化學多樣性，允許生物多樣性
  2. 基因組差異如何表達生物複雜性
  3. 生物序列資料表明所有生物都有共同的祖先
  4. 從極端環境生物中獲得的生物序列的獨特特徵
  5. 氧氣適應性生命、線粒體和葉綠體的遺傳起源
  6. 多細胞生物的遺傳起源
  7. 一個物種的定義不僅取決於任何特定個體的基因組，還取決於遺傳多樣性
  8. 物種內遺傳變異如何導致物種形成

• 第十一部分：其他型別的生物資料
  1. 醫學資訊學
  2. 環境或人口資料
  3. 形態學資料
  4. 關係資料庫和生物資料

• 詞彙表