GENtle/DNA 地圖
外觀
< GENtle

DNA 地圖用於顯示 DNA 序列(儘管在 蛋白質 模組中也使用了一種變體用於示意圖顯示)。它將線性或環狀(例如,質粒)DNA 序列顯示為地圖。
顯示:
| 對 | 滑鼠按鈕 | 功能 |
|---|---|---|
| 背景 | 左鍵 | 標記序列 |
| 左鍵(雙擊) | 開啟 序列編輯器 | |
| 中鍵 | 在序列中顯示標記的 DNA;如果沒有任何標記,則顯示序列中的當前位置 | |
| 特徵 | 左鍵 | 移動特徵顯示 |
| 左鍵(雙擊) | 編輯特徵(請參見 序列編輯器) | |
| 中鍵 | 標記與特徵匹配的 DNA | |
| 中鍵(shift按下) | 擴充套件當前標記區域以包括特徵的 DNA | |
| 限制酶位點 | 左鍵 | 移動位點顯示 |
| 左鍵(雙擊) | 編輯酶列表(請參見 序列編輯器) | |
| 中鍵 | 開啟 限制酶助手 | |
| 開放閱讀框 | 左鍵 | 標記 ORF 序列 |
| 左鍵(雙擊) | 標記並顯示 ORF 序列 | |
| 全部 | 右鍵 | 上下文選單 |
上下文選單在 DNA 地圖內的某個位置右鍵單擊時開啟。選單的內容取決於你在地圖中單擊的哪個物件。此外,根據物件的屬性,某些功能可能不可用,例如,沒有閱讀框的特徵的氨基酸。
| 編輯序列 | 開啟 序列編輯器 |
| 轉換序列 | 使序列反轉和/或互補 |
| 限制酶 | 將酶限制為最多切割 n 次的酶 |
| PCR/PCR | 啟動 PCR 模組 |
| PCR/正向 | 啟動 PCR 模組 並生成一個 5'->3'- 引物 |
| PCR/反向 | 啟動 PCR 模組 並生成一個 5'->3'- 引物 |
| PCR/兩者 | 啟動 PCR 模組 並生成兩個引物 |
| PCR/突變 | 啟動 PCR 模組 並生成重疊的誘變引物 |
| 選擇/剪下 | 刪除序列的選定部分並將其放入剪貼簿 |
| 選擇/複製 | 將序列的選定部分複製到剪貼簿 |
| 選擇/複製到新序列 | 基於選擇生成一個新的 DNA 序列條目 |
| 選擇/顯示在此切割的酶 | 開啟 沉默突變 對話方塊的變體,用於序列的選定部分 |
| 選擇/選擇作為新特徵 | 為序列的選定部分生成一個新的特徵 |
| 選擇/提取氨基酸 | 提取 DNA 序列選定部分的氨基酸序列 |
| 選擇/BLAST 氨基酸 | 對 DNA 序列選定部分的氨基酸序列執行 BLAST 搜尋 |
| 選擇/BLAST DNA | 對 DNA 序列選定部分執行 BLAST 搜尋 |
| 序列圖/另存為影像 | 將 DNA 地圖儲存為影像檔案 |
| 序列圖/將影像複製到剪貼簿 | 將 DNA 地圖作為點陣圖或 WMF(請參見 選項)複製到剪貼簿 |
| 序列圖/列印地圖 | 列印 DNA 地圖 |
| 顯示/隱藏 ORF | 切換開放閱讀框顯示 |
| 編輯 ORF | 調整開放閱讀框顯示 |
| 編輯限制酶 | 透過 序列編輯器 新增/刪除/管理限制酶 |
| 顯示/隱藏酶 | 切換酶的可見性(這將影響此序列中該酶的所有限制酶位點) |
| 刪除酶 | 從當前選擇中刪除酶(這將影響此序列中該酶的所有限制酶位點)。 這不會對自動新增的酶起作用(請參見 選項) |
| 標記限制酶位點 | 標記該酶在該限制酶位點的識別序列 |
| 標記並顯示限制酶位點 | 標記該酶在該限制酶位點的識別序列並在序列中顯示它 |
| 線上酶資訊 | 開啟該酶的 ReBase 頁面 |
| 新增到混合物 | 這將酶新增到限制酶混合物中(請參見 限制酶助手) |
| 新增到混合物 | 這將酶新增到限制酶混合物中(請參見 限制酶助手)並啟動限制 |
| 編輯特徵 | 編輯特徵屬性(請參見 GENtle/序列編輯器) |
| 隱藏特徵 | 從顯示中隱藏特徵 |
| 刪除特徵 | 刪除特徵 |
| DNA 序列/標記特徵序列 | 標記與特徵匹配的 DNA 序列 |
| DNA 序列/標記並顯示特徵序列 | 標記與特徵匹配的 DNA 序列並在序列中顯示它 |
| DNA 序列/複製(編碼)DNA 序列 | 將與特徵匹配的 DNA 序列複製到剪貼簿 |
| DNA 序列/此特徵作為新序列 | 基於特徵生成一個新的 DNA 序列 |
| DNA 序列/BLAST DNA | 對特徵的 DNA 執行 BLAST 搜尋 |
| 氨基酸序列/複製氨基酸序列 | 將特徵的氨基酸序列複製到剪貼簿 |
| 氨基酸序列/作為新條目 | 基於特徵的氨基酸序列生成一個新的蛋白質條目 |
| 氨基酸序列/Blast 氨基酸 | 對特徵的氨基酸序列執行 BLAST 搜尋 |
| 作為新特徵 | 從 ORF 生成一個新的特徵,具有適當的閱讀框和方向 |
| DNA 序列/複製 DNA 序列 | 將 ORF 的 DNA 序列複製到剪貼簿 |
| DNA 序列/作為新 DNA | 基於 ORF 的 DNA 序列生成一個新的 DNA 序列條目 |
| DNA 序列/BLAST DNA | 對 ORF 的 DNA 序列執行 BLAST 搜尋 |
| 氨基酸序列/複製氨基酸序列 | 將 ORF 的氨基酸序列複製到剪貼簿 |
| 氨基酸序列/作為新 AA | 基於 ORF 的氨基酸序列生成一個新的蛋白質條目 |
| 氨基酸序列/BLAST 氨基酸 | 對 ORF 的氨基酸序列執行 BLAST 搜尋 |