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GENtle/限制酶助手

來自華夏公益教科書,為開放世界提供開放書籍
GENtle: 工具和對話方塊

連線 - 選項 - 資料庫 - 匯入 - 輸入序列 - 序列編輯器 - 限制酶助手 - PCR 故障排除對話方塊 - 蛋白水解助手 - 專案 - 編輯引物對話方塊 - 查詢對話方塊 - 列印 - 酶管理 - 測序引物 - 沉默突變 - 自動註釋

限制酶助手。

限制酶助手可以透過選單“工具/酶助手”呼叫,也可以透過在 DNA 圖 中的限制位點上用滑鼠中鍵單擊來呼叫。對於後者,所選酶將自動在“可用酶”列表(左側)中選中。此列表取決於“組”和“子選擇”的選擇。可以透過單擊相應的列標題,按酶名稱或切割次數排序。對於選定的酶,生成的片段將顯示在左下角列表中。

右側的列表顯示“限制酶混合物”的內容,即已經選擇用於切割的酶。這些酶一起產生的片段顯示在右下角列表中。可以透過“新增到混合物”將左側列表中選定的酶放入混合物中;可以透過“新增所有”一次新增左側列表中的所有酶。可以透過在右側列表中選擇一個酶,然後透過“移除酶”將其從混合物中移除。

選中“不建立低於 ___ 個鹼基對的片段”時,會將生成的片段限制為最小大小。“完成”退出限制酶助手,同時保留對混合物所做的更改,而“取消”將取消所有所做的更改。

“開始限制”(剪刀符號)將啟動模擬限制。結果可以受到其他幾個設定的影響。

  • “建立片段”將生成實際的 DNA 序列及其鈍端/粘性末端,這些序列將是使用混合物進行消化產生的。此選項已預先選中。
  • “新增到凝膠”將片段新增到 虛擬凝膠 中,在一個泳道中一起新增。
  • “每個泳道一個”將改變上述情況,以便每種酶都有自己的泳道。
  • “部分限制”將向虛擬凝膠泳道新增所有可能的片段,模擬部分(不完全)限制。選中“部分限制”時,選項“每個泳道一個”不可用。

限制酶混合物將被保留,以便您可以使用相同的酶組合切割另一個 DNA,這對即將進行的 連線 很有用。

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