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對於每個軟體包，您都可以從 R 內部以 HTML 檔案的形式或從 CRAN 網站上以 PDF 檔案的形式獲得其參考手冊。您還可以經常在 R 雜誌、統計軟體雜誌等中找到小插圖或綜合文章。
library(help="package_name")
vignette("np",package="np")
vignette(all=FALSE) # vignettes for all attached packages
vignette(all=TRUE) # vignettes for all packages on the computer
您可以使用以下命令搜尋所有已載入軟體包中的幫助資訊：help()或?？。通常您不需要為函式名新增引號，但有時這可能很有用。args()給出函式的完整語法。
help(lm)
?lm
?"for"
?"[["
args("lm")
function (formula, data, subset, weights, na.action, method = "qr",
model = TRUE, x = FALSE, y = FALSE, qr = TRUE, singular.ok = TRUE,
contrasts = NULL, offset, ...)
# NULL
apropos()和find()搜尋已載入軟體包中包含關鍵字或正則表示式的所有函式[1]。
apropos("norm")
# [1] "dlnorm" "dnorm" "plnorm"
# [4] "pnorm" "qlnorm" "qnorm"
# [7] "qqnorm" "qqnorm.default" "rlnorm"
# [10] "rnorm" "normalizePath"
您可以使用以下命令搜尋所有已安裝軟體包中的幫助資訊：help.search()或其快捷方式??.
??"lm"
help.search("covariance")
RSiteSearch()搜尋所有軟體包以及 R 郵件列表中的幫助資訊。sos 軟體包使用以下命令改進了該函式：RSiteSearch()函式。findFn()函式。???是以下命令的包裝器：findFn().
RSiteSearch("spline")
library("sos")
findFn("spline", maxPages = 2)
???"spline"(2)
hints()hints 軟體包中的函式建議對物件進行什麼操作。
fit <- lm(y ~ x)
library("hints")
hints(fit) # returns a list of function using lm objects.
- R 簡介 R 參考手冊
- Robert Kabacoff 的 Quick R
- Grant Farnsworth 的 R 中的計量經濟學 經濟學家最好的入門讀物（約 20 頁）
- UCLA R 計算資源
- 使用R進行統計分析手冊 Brian S. Everitt 和 Torsten Hothorn 著
- 法語+英語 Arthur Charpentier 的精算師R教程
- Dan Goldstein 的影片教程
- 法語 Julien Barnier 的社會學家R入門教程
- Rosetta Code 展示了用不同程式語言解決同一任務的方案。
- John Cook 編著的“程式設計師的R語言”
- 計量經濟學R入門簡明指南
- Kelly Black 的R教程
- François Briatte 提供了一個使用R進行資料分析的優秀入門教程[2]
- Simon Jackman 政治方法論課程
- Jonathan Katz 政治方法論課程
- 計量經濟學R入門簡明指南
- PRISM 研討會
- 統計分析：使用R的入門教程 - 包含一個R課程
- 使用R進行生物統計 又名 Wayne Daniel 的《生物統計學》書籍的R伴侶
- Planet R 第一個R部落格聚合器
- R 部落格 R 部落格圈的新聞脈搏
- "R" 你準備好了嗎？
- 每天一個R技巧
- Revolution Computing 部落格
- Yu Sung Su 的部落格：R
- （法語） Freakonometrics（法語） 許多程式碼片段
- （法語） Baptiste Coulmont（法語）
- （法語） Quanti Sciences Sociales（法語） 社會學家的R部落格
- Venables 和 Ripley：使用S進行現代應用統計
- 一個涵蓋眾多主題的非常好的R入門教程。
- 使用R進行統計分析手冊（Brian S. Everitt 和 Torsten Hothorn 著，Chapman & Hall/CRC，2008）
- Paul Murrell 編著的《資料技術入門》
- 你需要了解的所有關於資料管理的知識
- 使用R進行統計程式設計入門，John Braun 和 Duncan Murdoch 著。
- Peter Dalgaard (2009)。ISwR：使用R進行入門統計。R 包版本 2.0-4。 http://CRAN.R-project.org/package=ISwR
- Springer 使用R系列
- John Fox：應用迴歸的R和S-PLUS 伴侶
- Gelman Hill：使用迴歸和多層次分層模型進行資料分析
- R seek
- 使用關鍵詞“lang:r”的Google 程式碼搜尋 可以訪問包括請求在內的R程式。例如，以下請求
optim lang:r可以訪問所有包含optim的R程式。
- Nabble R http://r.789695.n4.nabble.com/
- Stack Overflow
- Twitter 上的#rstats 標籤
- IRC：#r@freenode
- r-soc：法國社會學家的郵件列表